Discussion :

[eskapp]

Bonjour,

Après avoir écumé le web pendant des jours pour compiler des fichiers mex, j'appelle à l'aide !
Je souhaite travailler avec ces codes Matlab ici. Ca contient des fichiers en cpp, que j'ai besoin de compiler à l'aide d'une fonction fournie.

N'ayant pas de compiler sur mon ordinateur, j'ai commencé par installer TDM-GCC-64, car j'ai besoin d'utiliser openmp, j'ai utilisé gnumex pour pouvoir indiquer à Matlab d'utiliser ce compiler, j'ai modifié le path, enfin bref je pense avoir installé le truc correctement.
J'ai ensuite dû modifier le fichier mexopts.bat comme expliqué ici pour faire fonctionner la compilation d'un fichier exemple tout simple : yprime.c fourni avec Matlab. Ca marche pour ce fichier là mais pour le code que j'essaie de compiler, j'obtiens l'erreur suivante :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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collect2.exe: error: ld returned 1 exit status 
 
  C:\PROGRA~1\MATLAB\R2013B\BIN\MEX.PL: Error: Link of 'C:\Users\Elise\Desktop\AFIS\CSH_code_v3\C_and_Mex\votemex.mexw64' failed. 
 
Unable to complete successfully.

J'ai modifié mon fichier mexopts.bat en m'inspirant de ce lien. Ca n'a rien changé... J'obtiens toujours cette même erreur et je suis à court d'idées pour solutionner ça.

J'ai bien trouvé cette discussion sur ce forum http://www.developpez.net/forums/d14...w-erreur-link/ Je ne comprends pas les réponses malheureusement, un peu trop technique pour moi... J'ai l'impression que le problème vient de Mingw ou de mon fichier mexopts.bat.

Quelqu'un a-t-il une idée ?

J'utilise Matlab 2013b sous Windows 8.1.
La commande Matlab utilisée :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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mex OPTIMFLAGS="-DNDEBUG -DMEX_MODE -fopenmp"  knn.cpp mexutil.cpp nn.cpp votemex.cpp patch.cpp vecnn.cpp
simnn.cpp allegro_emu.cpp -output ../votemex

Le .bat :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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@echo off
 
:: Set this to your Mingw64 top folder, where you extracted the above
set MINGWPATH=C:\TDM-GCC-64
 
:: Leave these alone unless you know what you're doing.
set PATH=C:\TDM-GCC-64\x86_64-w64-mingw32\bin;%PATH%
set PRELINK_CMDS=echo.>%TEMP%\mexstaticlibs
 
:: You can have MEX run some commands before calling the linker.
:: The two examples below will cause gcc to output the full path to some
:: static libraries so you can link statically to them (see the
:: LINGFLAGSPOST special var below). You can set any command here, however.
rem set PRELINK_CMDS1=gcc -print-file-name=libwinpthread.a >> %TEMP%\mexstaticlibs
rem set PRELINK_CMDS2=gcc -print-file-name=libquadmath.a >> %TEMP%\mexstaticlibs
rem set PRELINK_CMDS3=...
 
:: You can have MEX run some commands also after calling the linker
:: (e.g. upx compress the output .mex)
rem set POSTLINK_CMDS1=upx -9 "%OUTDIR%%MEX_NAME%%MEX_EXT%"
rem set POSTLINK_CMDS2=...
 
:: You can change these if you really need to.
set COMPILER=g++
set COMPFLAGS=-c -I"%MATLAB%\extern\include" -DMATLAB_MEX_FILE
set OPTIMFLAGS=-O3 -funroll-loops -DNDEBUG
set DEBUGFLAGS=-g
set NAME_OBJECT=-o
 
set LINKER=x86_64-w64-mingw32-g++
set LINKFLAGS=-shared -static-libstdc++ -static-libgcc -L"%MATLAB%\bin\win64" -L"%MATLAB%\extern\lib\win64\microsoft"  -leng -lmwlapack -lmwblas
set LINKFLAGSPOST=@%TEMP%\mexstaticlibs -lmx -lmex -lmat
set LINKOPTIMFLAGS=-O2
set LINKDEBUGFLAGS=-g
set NAME_OUTPUT=-o "%OUTDIR%%MEX_NAME%%MEX_EXT%"

[Jerome Briot]

Tu peux créer un fichier batch mexgcc.bat basé sur cet exemple :

Code bat :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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@echo off
 
set GCCPATH=C:/TDM64/bin/
set CC=x86_64-w64-mingw32-gcc
 
set MATLABPATH=C:/MATLAB/R2014b/
set arch=64
 
if exist %1.mexw%arch% del %1.mexw%arch%
 
%GCCPATH%%CC% -m%arch% -fopenmp -shared -I"%MATLABPATH%extern/include" -DMATLAB_MEX_FILE -o %1.mexw%arch% -Wl,--export-all-symbols %1.c -L"%MATLABPATH%bin/win%arch%" -lmex -lmx -leng -lmat

Il faudra sans doute adapter la définition des variables au début du code.

Avec un exemple simple test_openmp_helloworld.c (adapté de l'ouvrage Using OpenMP: Portable Shared Memory Parallel Programming (Scientific and Engineering Computation) :

Code C :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#include <omp.h>
#include <mex.h>
 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[],
        int nrhs, const mxArray *prhs[])
 
{
 
int nthreads, tid;
 
/* Fork a team of threads with each thread having a private tid variable */
#pragma omp parallel private(tid)
  {
 
  /* Obtain and print thread id */
  tid = omp_get_thread_num();
  mexPrintf("Hello World from thread = %d\n", tid);
 
  /* Only master thread does this */
  if (tid == 0) 
    {
    nthreads = omp_get_num_threads();
    mexPrintf("Number of threads = %d\n", nthreads);
    }
 
  }  /* All threads join master thread and terminate */
 
}

A compiler comme ceci depuis le Command Window de MATLAB :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

!mexgcc.bat test_openmp_helloworld

Ce qui donne normalement (au nombre de thread près) :

Code :

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>> test_openmp_helloworld
Hello World from thread = 0
Number of threads = 8
Hello World from thread = 1
Hello World from thread = 5
Hello World from thread = 4
Hello World from thread = 7
Hello World from thread = 2
Hello World from thread = 6
Hello World from thread = 3

[eskapp]

Salut

Merci beaucoup de t'intéresser à mon problème ! J'ai fait ce que tu m'as dit à savoir, créer le mexgcc.bat que j'ai rangé au même endroit que le mexopts.bat. J'ai ensuite copié-collé le fichier .c dans mon répertoire de travail.

J'obtiens cependant une erreur lorsque j'utilise la commande

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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!mexgcc.bat test_openmp_helloworld
'mexgcc.bat' n'est pas reconnu en tant que commande interne 
ou externe, un programme ex‚cutable ou un fichier de commandes.

Pourtant, lorsque je tape dans la commande Windows:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

mexgcc.bat test_openmp_helloworld

Il semble reconnaître le fichier puisque l'erreur est différente:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

x86_64-w64-mingw32-gcc: error: libgomp.spec: No such file or directory

Si j'ai bien compris, l'erreur que renvoie Matlab est une erreur de l'OS. J'ai ajouté ce qui suit dans les variables d'environnement Windows, sans succès...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

C:\TDM-GCC-64\bin;C:\Users\Elise\AppData\Roaming\MathWorks\MATLAB\R2013b;C:\TDM-GCC-64\x86_64-w64-mingw32\bin;

Une idée pour faire reconnaître ce fichier à Matlab?

[Jerome Briot]

Pour ton premier problème, tu dois mettre le fichier mexgcc.bat dans le même dossier que ton fichier .c

Pour le deuxième problème, as-tu bien sélectionné OpenMP lors de l'installation de TDM-GCC ?

[eskapp]

Pour ton premier problème, tu dois mettre le fichier mexgcc.bat dans le même dossier que ton fichier .c

En effet, ça fonctionne mieux^^ Je saisis pas trop ce que ce fichier fait, je veux bien un petit éclairage sur ce point

Pour le deuxième problème, as-tu bien sélectionné OpenMP lors de l'installation de TDM-GCC ?

Ouuuuuups! Bon ben, j'ai coché et ça a marché sur le code exemple Merci !

Je teste tout ça cet aprem sur mon code principal et je reviens vers vous si problème.

En tout cas, merci encore pour l'aide !

[Jerome Briot]

Je saisis pas trop ce que ce fichier fait, je veux bien un petit éclairage sur ce point

Si tu remplaces les variables par leurs valeurs, le fichier ne fait qu'exécuter la commande suivante :

Code bat :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

C:/TDM64/bin/x86_64-w64-mingw32-gcc -m64 -fopenmp -shared -I"C:/MATLAB/R2014b/extern/include" -DMATLAB_MEX_FILE -o test_openmp_helloworld.mexw64 -Wl,--export-all-symbols test_openmp_helloworld.c -L"C:/MATLAB/R2014b/bin/win64" -lmex -lmx -leng -lmat

Pour chaque option, il faut consulter la documentation de GCC :

• Options Controlling C Dialect
• Options Controlling the Preprocessor
• Options for Linking
• Options for Directory Search