Discussion :

[Obitruc]

Bonjour.

J'essaye d'utiliser la fonction Label... sur un stack avant de le convertir en video.

J'ai créée des boîtes de dialogues permettant de faire varier les paramètres, puis j'ai placé les variables dans la fonction afin d'en retourner leur valeur.

J'ai vérifié la valeur des mes variables par un print("variable", variable); et tout est en ordre.
Cependant une fois dans la fonction Label, impossible de retourner leur valeur. Si je rentre les paramètres à la place des variables dans la fonction, tout marche nickel.

Ci-joint ma macro, ainsi qu'une image exemple du résultat obtenu.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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run("Close All");
dir1 = getDirectory("Choose Root Image Folder");
 
dirSaveMovies = dir1 + "Movies" + File.separator;
if (File.exists(dirSaveMovies)){} else {File.makeDirectory(dirSaveMovies);}
 
dir2 = dir1 + "RawData" + File.separator;
list2 = getFileList(dir2);
 
for (i=0; i<(list2.length); i++) {
 
	dir3 = dir2 + list2[i];
	list3 = getFileList(dir3);
	file = dir3 + list3[i];
 
	if (endsWith(file, ".tif")) {
			run("Image Sequence...", "open=file convert");
			run("Set Scale...", "distance=0 known=0 pixel=1 unit=pixel");
			id1=getImageID();
 
			Dialog.create("Need to rotate?");
			s0="Do you want to do a rotation?";
			Dialog.addMessage(s0);
			Dialog.addCheckbox("Rotation", 1);
			Dialog.show();
			rotate = Dialog.getCheckbox();
 
			if (rotate == 1) {
				setTool("angle");
				waitForUser("Measure the rotation angle");
				Dialog.create("Measure the rotation angle");
				Dialog.addNumber("Angle value", 15);
				Dialog.show();
				angle = Dialog.getNumber();
				run("Rotate... ", "angle=&angle grid=1 interpolation=Bilinear stack");
			} 
 
			Dialog.create("Parameters");
			s2="Fill in the fields";
			Dialog.addMessage(s2);
			Dialog.addString("Acquisition date (without space)", "");
			Dialog.addString("Strain name", "");
			Dialog.addString("Microscopy", "");
			Dialog.addString("Complementary data (without space)", "");
			Dialog.addChoice("Bin value", newArray("1", "2"));
			Dialog.addNumber("Acquisition Step in seconds", 0.5);
			Dialog.addString("Time unity", "sec");
			Dialog.addChoice("Movie's format (Warning: Quicktime format is not supported by Fiji)", newArray("Avi", "Quicktime"));
			Dialog.show();
			bin = Dialog.getChoice();
			date = Dialog.getString();
			souche = Dialog.getString();
			micro = Dialog.getString();
			info = Dialog.getString();
			time = Dialog.getNumber();
			unity = Dialog.getString();
			format = Dialog.getChoice();
			if (bin == 1) { makeRectangle(188, 114, 1050, 700);
			} else { makeRectangle(188, 114, 525, 350); }
 
			waitForUser("Place properly the rectangle around the embryo");
			run("Crop");
 
			slice=nSlices;
 
 
 
			//run("Time Stamper", "starting=0 interval=" + time + "x=20 y=20 font=20 '00 decimal=2 anti-aliased or=sec");
			run("Label...", "format=00:00 starting=0 interval=" + time + "x=20 y=20 font=20 text=" + unity + "range="+ slice);
 
			if (format == "Avi") {
			saveAs("Avi", dirSaveMovies + date + "_" + souche + "_" + micro + "_" + info + "_" + i + 1 + ".avi");
			} else {
			saveAs("QuickTime Movie...", "compression=MPEG-4 quality=High frame=10 save=" + dirSaveMovies + date + "_" + souche + "_" + micro + "_" + info + "_" + i + 1 + ".mov");	
			}
 
			run("Close All");
 
	}	
}

[Obitruc]

Je poste la solution, si jamais quelqu'un avait le même souci, j'espère que ça pourra l'aider:

dans cette petite ligne de code :

run("Label...", "format=00:00 starting=0 interval=" + time + "x=20 y=20 font=20 text=" + unity + "range="+ slice);

Si on fait un :

print(format=00:00 starting=0 interval=" + time + "x=20 y=20 font=20 text=" + unity + "range="+ slice)

on se rend compte qu'il y a 3 erreurs :

- il manque un espace entre interval et x
- il manque un espace entre text et range
- il manque 1- avant le +slice

la bonne commande est donc :

run("Label...", "format=00:00 starting=0 interval=" + time + " x=20 y=20 font=20 text=" + unity + " range=1-"+ slice);

Voila voila.

N'hésitez pas à me contacter si des questions vous avez !