Discussion :

[Tchoukatroc]

Bonjour,



J'aimerais savoir s'il existe une méthode qui me permettrait d'isoler des zones de mon image sans passer par un threshold manuel. A gauche, voici mon image de base, dans laquelle j'aimerais mesurer l'intensité des spots à l'intérieur de ma cellule. A droite, une segmentation de mon image de base que j'ai obtenu un faisant un threshold, que j'ai converti en mask et dans lequel j'ai supprimé le bruit grâce à la fonction "Noise --> Remove Outliers...". Je cherche à comparer l'intensité de ces spots dans différentes populations de cellules. Le problème est que je définie le threshold de façon manuelle, donc subjective ce qui risque de biaiser le résultat. Quelqu'un connait il une méthode pour calculer le threshold de manière automatique, ou une autre méthode de segmentation que par le threshold qui fonctionnerait sur mes images?

Je vous remercie d'avance.