Discussion :

[Asma.md2002]

Bonjour tout le monde,

Mon programme fonctionne correctement jusqu’à ce que j'ai fait la lecture d'un fichier volumineux de taille 202Mo.

Une erreur s'est produite:

"Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space"

J'ai augmenté la taille maximale de la mémoire allouée pour JVM en modifiant VM argument (-Xmx) mais l'erreur persiste.

Encore j'ai eu l'affichage de :

"Error occurred during initialization of VM! Could not reserve enough space for object heap"

Mon système est de 32 bit, RAM = 4GO

Je me suis bloquée!

Je vous serais très reconnaissante si vous pouviez m'aider

Merci d'avance!

[wax78]

Non l'erreur ne persiste pas. Un out of memory c'est different que "couldn't reserve enough space".

Ce deuxieme message indique que tu demandes plus de mémoire que ce que ne permet la VM, qui je presume est en 32 bit et donc t'interdira d'allouer plus que ce qui est possible d'adresser.

Donc soit tu passes en 64 bit.

Soit tu cherches dans ton code pourquoi ton petit fichier de 200 megas ne rentre pas dans la mémoire...

[plawyx]

Bonjour tout le monde,

Mon programme fonctionne correctement jusqu’à ce que j'ai fait la lecture d'un fichier volumineux de taille 202Mo.

Une erreur s'est produite:

"Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space"

Es-tu obligé de chargé l'intégralité du fichier dans ton programme? Quel type de traitement subit-il ?

[Asma.md2002]

Merci plawyx et wax78 pour vos réponses.

oui je dois charger le fichier en entier. il va jouer le rôle d'une base qui contient des informations sur des protéines.
L'utilisateur indique les protéines à rechercher et je vais afficher les informations relatives à ces protéines à partir de cette base ( notre fichier ).

Comment faire pour migrer vers un système de 32 bit ?

[tchize_]

tu es sur un système 32 bits, donc java est limité à +- 1G de mémoire (ça dépend un peu de l'OS)

La question posée, c'est qu'est-ce que tu fous dans ton code pour que ce fichier de 200M nécessite >1G pour le traitement

C'est 5 fois plus que la taille du fichier. Tu peux utiliser un OS 64 bits et une java 64 bits pour dépasser cette barrière de 1G, mais c'est plutot une fuite en avant.

[plawyx]

oui je dois charger le fichier en entier. il va jouer le rôle d'une base qui contient des informations sur des protéines.
L'utilisateur indique les protéines à rechercher et je vais afficher les informations relatives à ces protéines à partir de cette base ( notre fichier ).

tu peux donc lire le fichier et extraire les données relatives aux protéines sélectionnées sans pour autant stocker les autres données dans la jvm (ce que tu sembles faire: charger le fichier).

Comment faire pour migrer vers un système de 32 bit ?

200 Mo, même avec une jvm 32 bits: cela doit le faire. Peux-tu nous donner plus d'infos sur ton programme, son code et sa gestion des ressources (et libérations des ressources surtout)? Il y a peut-être des couacs de ce coté là.

[Asma.md2002]

Merci plawyx & tchize. Vous avez raison : )

J'ai modifié mon code et le problème est résolu. J'ai pu l'exécuter finalement .

Merci pour vos contributions.