Discussion :

[Oleska]

Bonjour à tous!!!
People, please!!!! J'ai besoin votre aide. Je ne me connais pas trop dans le logiciel, j'ai lu le tutoriel, mais j'arrive pas à trouver la reponse....
J'ai besoin calculer l’intégral de la courbe après d'avoir fait Analyse-Plot Profile. SVP pourriez vous m'aider comment faire.
Merci beaucoup d'avance

[ToTo13]

Peut être pourrais tu exporter la courbe comme une liste de points et faire la somme de tous les coordonnées en Y.

[Oleska]

Merci beaucoup ToTo13!
Je vais faire cela!!! Mais Peut être tu peux me conseiller d'autre chose. Je fais l'analyse de deux échantillons de bouillon. Une échantillon est moins troublé que l'autre. Alors j'ai besoin montrer qu'ils ont différents turbidités.

Donc, j'ai pris les photos de bouillon en passant le rayon du lazer. La zone de distribution de la lumière rouge est plus importante dans une échantillon qui est plus troublée (évidemment).
Finalement j'ai fais le plot profile de la zone de distribution de la lumière rouge et maintenant je calculerai la somme de valeur Y de chaque échantillon.

Mais il y a des inexactitude quand je select la surface d’intérêt (la zone de distribution de la lumière rouge).
Pourrais tu conseiller comment je peux en analysant la distribution de la lumière rouge montrer la différence entre deux échantillons? Ouuuf je sais pas si je suis assez claire.....

Je te remercie beaucoup pour ton temps et assistance.

[ToTo13]

Fais voir les images !

Une granulométrie pourrait peut être caractériser correctement tes échantillons. Mais images pour confirmer.

Puisque tu peux passer un laser, peux tu simplement prendre deux images ?

[Oleska]

Bonjour ToTo13!

Ci joint les images avec le lazer. Ainsi j'ai pris des photos sans lazer, mais dans 2 échantillon les particules sont plus fin et il y a en plus qui sont suspendu dans la solution que dans le 1re. J'espère que cela se voit bien dans les photos

Très bonne journée

[Oleska]

Pour faire le granulométrie, il fait avoir l'équipement.... ? on n'en a pas à l'école... :-(((( Pour cela le prof m'a dit utiliser le lazer et imagej....

[ToTo13]

La granulométrie est une opération de traitement du signal (morphologie mathématique), donc tu n'as pas besoin d'équipement, mais d'images.

Tout d'abord il te faut faire de meilleures images :
- zoomer QUE sur la partie avec le laser.
- centrer que sur l'échantillon
- éviter les reflets lors de la prise de photos.
Sinon il faudra un travail considérable pour nettoyer les images de tous les artéfacts parasites avant de pouvoir analyser la partie utile.

Si tu arrives à faire de meilleures images, je confirme la granulométrie.

[Oleska]

Bonjour ToTo13!!!

J'ai essayé faire des meilleurs images. Qu'est-ce que t'en penses?

Pour faire le granulométrie analyse quelle logiciel je dois utiliser??? Je suis très confus...

Je te remercie sincèrement pour ton temps que tu prends pour me repondre

[ToTo13]

Les images sont de meilleures qualité, c'est indéniable.
Par contre, je n'aime pas le laser, car il change complètement l'éclairage en plein milieu de l'image.

Ce qu'il faudrait donc faire maintenant :
- faire des images sans le laser.
- recouper les images pour que l'on ne voit que le liquide (pas de bords)
- convertir en niveaux de gris
- améliorer l'éclairage, voire le contraste
- granulométrie.

Toutes les étapes d'amélioration et de granulométrie peuvent être réalisées avec ImageJ. Pour la granulométrie, tu trouveras un plugin qui a l'air de faire cela très bien.

[Oleska]

Ok, super! Je vais essayer de le faire. GROS MERCI!!!!!

[Oleska]

Bonjour,

Je voulais vous poser la dernière question.... Quand je fais l'analyse de granulométrie, le résultat de densité est négatif!!! Est-ce que c'est normal? et si oui, pourquoi c'est comme ça?

Je vous remercie pour vos réponses

[ToTo13]

Si c'est une granulométrie (utilisant une ouverture), cela n'est pas normal.
En revanche si une anti-granulométrie (utilisant une fermeture) a été aussi calculée, alors oui.
Cf. ici.

Je viens de tester celui-là, il a l'air correct.

[Oleska]

Bonsoir ToTo13

Ci-joint les photos que j’essaie analyser. D'après le tutoriel que j'ai lu sur le site que vous m'avez envoyé je peux mesurer la difference entre deux image en calculant la somme des niveaux de gris de chaque image. Dans le tutoriel a été precisé que la somme des niveaux de gris de chaque image est la valeur V.

Alors j'applique grayscale granulometry (in diameter) in closing operation (square) j’obtiens la courbe de grayscale variation pour chaque images in %. Après je calcule la somme de grayscale variation pour chaque image et alors elle est presque identique avec la petite difference 97,881 (pour image 1) et 97,869 (pour image 2), tandis que la difference visuelle est beaucoup plus évident.
Dans le tutoriel n'est pas expliqué qu'est-ce que signifie les valeurs obtenu, et comment je peux les utiliser pour interpréter les résultat d'analyse....

Pourriez vous s'il vous plait clarifier mes difficulté?

J’apprécie énormément votre aide.

[ToTo13]

D'après le tutoriel que j'ai lu sur le site que vous m'avez envoyé je peux mesurer la difference entre deux image en calculant la somme des niveaux de gris de chaque image. Dans le tutoriel a été precisé que la somme des niveaux de gris de chaque image est la valeur V.

Très discutable et vrai que si les images sont prises exactement dans les mêmes conditions. Je n'avais pas vu ce passage dans le tutoriel et je ne ferai pas cela.

Alors j'applique grayscale granulometry (in diameter) in closing operation (square) j’obtiens la courbe de grayscale variation pour chaque images in %. Après je calcule la somme de grayscale variation pour chaque image et alors elle est presque identique avec la petite difference 97,881 (pour image 1) et 97,869 (pour image 2), tandis que la difference visuelle est beaucoup plus évident.

Tu es intéressé par les particules en suspension dans tes images. Un closing va les préserver tout au long des opérations, alors qu'un opening va les éliminer au fur et à mesure en fonction de leur taille.
Il faut donc faire un opening.

Dans le tutoriel n'est pas expliqué qu'est-ce que signifie les valeurs obtenu, et comment je peux les utiliser pour interpréter les résultat d'analyse....

Je te conseille de faire un rapide état de l'art en morphologie mathématique, afin de comprendre les opérations : érosion, dilatation, ouverture (opening) et fermeture (closing). Et enfin "granulométrie". Comme cela tu comprendras ce qui se passe.
En gros, une ouverture (opening, si tu utilises un closing c'est une anti-granulométrie) de taille N va supprimer toutes les particules de taille inférieure à N. Ensuite la granulométrie fait une différence entre deux ouverture successive et normalise en fonction de l'image de référence.
Donc dans la courbe résultat, l'abscisse est la taille de l'opération et l'ordonné la quantité résultante, ici on dirait le pourcentage (mais je ne sais pas trop pourquoi).
Donc avec une ouverture, tu aurais donc la quantité de particule avec un taille N.

Comme je l'ai dit, oublie la somme et compare les courbes.



Remarques :
- 1 - en traitement d'images, on ne travaille jamais (ou le moins possible) avec du JPG, utilise le png ou tout autre format de compression sans perte. Tu auras des images beaucoup plus nette à analyser et donc des meilleurs résultats.
- 2 - je ne suis pas certain qu'avoir des images couleurs soit utile, 256 niveaux de gris devraient suffire dans ce cas.
- 3 - Tu as une source de lumière sur la gauche de tes échantillons lorsque tu prends tes photos. Si on passe en niveaux de gris et que l'on étire l'histogramme, cela se voit clairement (clair à gauche et sombre à droite).

Je viens de tester le plugin que je t'ai donné en lien et on voit une nette différence de tracé.

[Oleska]

Bonjour ToTo!

Je voulais vous dire sincèrement un Gros Merci pour votre temps et les réponses très rapide!!!!!!!

J'ai enfin réussi d'avoir les résultats pas mal!!!!! Vous m'avez énormément aidé!!!!

Très Bonne journée