Bonjour,
je dois réaliser la mise en place d'une fonction de mise à jour sur une base de données protéique. Cette mise à jour se base sur Uniprot. En gros, TOUT Uniprot est récupéré sous forme d'un fichier dat.gz et on sélectionne les protéines qui nous intéressent selon des critères spécifiques. Le fichier à traiter est énorme (14Go) et donc juste impossible en PHP. J'aimerais donc avoir vos avis sur la manière de procéder. Je pensais à créer un programme PERL (possible de lire directement fichier compressé ?), mais relier PHP, PERL et SQL, est-ce possible ?
Merci.