Discussion :

[anna1980]

Bonjour!
J'ai un fichier texte qui contient par exemple :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
 
 
YPKVKR
YPK-KR
TP-SRR
TPKSRR

et je veux mettre ces données dans une matrice comme ceci :


1 2 3 4 5 6
Seq1 Y P K V K R
Seq2 Y P K - K R
Seq3 T P - S R R
Seq4 T P K S R R

j'ai commencé par ceci une liste de listes:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
 
alignment_dict=[]
    with open ('alignment.txt') as f:
        for line in f:
            line=line.strip()
 
            alignment_dict.append(map(str,line))

je veux calculer l'occurance de chaque lettre dans une colonne .et je sais pas comment faire ca .
quelqu'un peut m'aider ?
merci d'avance