salut
j'ai un fichier qui contient des sequences du nucleotides :
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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4
 
CGC
GGT
GAG
et je veux construire un dictionaire a partie de ces donnees comme ceci:

j'ai fait un programme mais ca marche pas tellment :
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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#!/usr/bin/env python
def position(c):
    if c=='A':
        pos = 0
    if c=='C':
        pos = 1
    if c=='G':
        pos = 2
    if c=='T':
        pos = 3
    return pos
 
 
 
 
 
 
def create_dict(seq):
 
    for i in range(0,len(seq)):
 
        q=seq[i]
        a= position(q)
 
        for j in range(0,len(dict[i])):
            if j==a:
 
                dict[i][j]='true'
            else:
                dict[i][j]='false'
 
 
liste=['CCG','AAT','CTG','TAG']
for seq in liste:
    dict = {}
 
    create_dict(seq)