Discussion :

[linus987]

Salut,

J'aimerai récupérer le résultat des algorithmes que j'exécute depuis mon application java.

Voici un exemple :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

IJ.run(imp, "Analyze Particles...", "size=0-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Nothing display clear summarize in_situ");

Cette commande m'affiche le nombre de cellules comptées dans une image.

J'aimerai pouvoir récupérer le résultat dans une variable.

Les anciennes version d'ImageJ proposait :

IJ.nresult ou IJ.getResult. Mais ce n'est plus le cas avec la dernière version.

Il existerait un type ResultTable mais je n'arrive pas à l'utiliser.

Auriez-vous une idée ?

Merci d'avance

[ToTo13]

Si c'est une PluginFilter, deux fenêtres seront créées pour le résultat et la dernière contiendra l'image. En fait le WindowManager contient deux nouvelles fenêtres.

Par contre pour un Plugin classique, il n'y a aucune contrainte de sortie :-(

Le plus simple restant toujours à mon avis de modifier / extends le classe qui t'intéresse afin d'ajouter des getters pour récupérer ton résultat.

[linus987]

Salut,

Merci pour ta réponse.

En fait, j'ai trouvé une parade.

Voici les étapes que je réalise :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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ResultsTable rt = new ResultsTable();
Analyzer a = new Analyzer();
 
IJ.setAutoThreshold(imp, "Default");
IJ.run(imp, "Convert to Mask", "");
IJ.run("Close");
IJ.run(imp, "Watershed", "");
IJ.run(imp, "Analyze Particles...", "size=0-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Nothing display in_situ");
IJ.saveAs("Results", "/Users/USERNAME/Desktop/Results.xls");
 
a.getCounter();

J'ai pas encore bien appréhender le ResultsTable. La documentation n'est pas super claire je trouve. Par contre, je vais un "saveAs" pour écrire un fichier XLS contenant tous les résultats.

Et il est possible d'utiliser certaines méthodes de Analyzer ou ResultsTables comme par exemple getCounter() qui me donne le nombre de cellules comptées grâce à cet algo.

Merci encore pour ta réactivité