Discussion :

[YOUGZ]

Bonjour à tous, je travaille actuellement sur la fusion d'images IRM-scanner et je débute sur imageJ.
J'ai besoin de créer une macro qui permettent de détecter des contours afin de tracer ensuite des ROIs. Existe-t-il déjà des fonctions permettant de faire cela?
Sinon je veux bien quelques conseils pour coder tout ça .

Merci d'avance!

PS: j'ai cherché à savoir si une présentation pour les nouveaux membres est nécessaire, j'ai pas trouvé...

[ToTo13]

Pour l'instant, c'est un problème de détection de contour et non d'ImageJ.
Pose donc ta question en ajoutant des images d'exemple dans le forum "Autres langages/Algorithmes/Traitement d'Images".

[deby56270]

Bonjour,

Pour faire de la segmentation d'image, tu peux utiliser le plugin d'imageJ YAWI 3D, ou 2D. Il faut juste que tu le télécharges et l'installes dans les plugins d'imageJ.


J'espère que ça pourra t'aider

[YOUGZ]

J'ai résolu mon problème de détection de ROIS, mais je rencontre à nouveau des difficultés cette fois ci vraiment propre à ImageJ.
Je souhaiterai obtenir des coupes coronales à partir de ma séquence d'images axiales. Le plugin volume viewer me le permet mais le problème est qu'il enregistre automatiquement les coupes en "jpg" et je perd toutes les valeurs de nombre Hounsfield dont j'ai besoin.

Avez-vous une solution? Existe-t-il un autre plugin permettant de changer le plan de coupe? Sinon est-ce qu'il n'est pas plus simple de faire directement une MPR sur la console du scanner?...


Merci d'avance.

[deby56270]

C'est très facile, Voici le chemin dans ImageJ pour changer de coupes : Image-->Stacks-->Reslice et après tu choisis dans quel sens tu veux obtenir tes coupes. Par exemple si tu as des coupes transversales et que tu souhaites des coupes sagitales tu choisis soit Left ou Right tout dépend si tu souhaites obtenir tes coupes en partant de la tête ou des pieds.

Voila j'espère que c'est clair