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Calcul scientifique Python Discussion :

Traitement d'une pile d'images


Sujet :

Calcul scientifique Python

  1. #1
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    Par défaut Traitement d'une pile d'images
    Bonjour, j'ai un projet à réaliser et je dois créer un programme pour traiter des images pour relever les valeurs d'intensité pour chaque pixels.

    Mais j'obtiens des résultats pas très pratiques à manier j'aimerais que les intensités soient affichées en colonnes et à côté le numéro d'image pour ensuite réaliser des graphiques.

    Quelqu'un pourrait-il m'aider ?

    Voici mon programme :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    import Image
    im = Image.open("nov0311a1_8_8bits.tif")
    F0= 158
    for i in range(0,60):
        im.seek(i)
        region = im.crop((52,20,62,28))
        cc = region.getcolors()
        print (cc,i)

  2. #2
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    Par défaut
    ho ! mon code

    comme ça ?

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    import Image
    im = Image.open("nov0311b1_10_8bits.tif")
    F0= 158
    for i in range(0,60):
        im.seek(i)
        region = im.crop((52,20,62,28))
        for n,cc in region.getcolors():
            print "image num :",i,"nombre de pixel d'intensite",cc,":",n

  3. #3
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    Par défaut
    Ah super merci !
    Par contre quand je veux enregistrer les résultats je fais :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    fout=open( "test.csv", "w")
    for i in range (0,60):
        output = str(cc)+"\t"+str(i)+"\n"
        fout.write (output)
    fout.close()
    ça m'affiche : " fout=open( "test.csv", "w")
    IOError: [Errno 13] Permission denied: 'test.csv' "

  4. #4
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    Par défaut
    tu n'as pas le droit d'écrire dans le répertoire courant ...

  5. #5
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    Par défaut
    Ah mince !
    Pourtant avant sur le code de départ j'arrivais à enregistrer les résultats avec ce code là. Comment puis-je faire ?

  6. #6
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    Par défaut images
    Salut,
    moi je te propose ça pour tes images

    il faut Pil et matplotlib


    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    import Image
    import matplotlib.pyplot as plt
    import sys
     
    filename = sys.argv[1]
     
    im = Image.open(filename)
    data = list(im.getdata())
    r,g,b = im.split()
     
     
    red 	= r.getdata() 
    green 	= g.getdata() 
    blue 	= b.getdata() 
     
     
    if '-s' in sys.argv:
    	size = range(256)
    	plt.title('intensity')
    	plt.plot(size,r.histogram(),'r')
    	plt.plot(size,g.histogram(),'g')
    	plt.plot(size,b.histogram(),'b')
    	plt.show()
     
    if '-o' in sys.argv:
    	o = open(filename + '.csv','w')
    	o.write('r\tg\tb\n')
    	hr = r.histogram()
    	hg = g.histogram()
    	hb = b.histogram()
     
    	for d in xrange(255):
    		o.write('%s\t%s\t%s\n' % (hr[d],hg[d],hb[d]))
    	o.close()
    tu peux afficher les resultats avec l'option -s et les sortir en csv avec -s
    exemple : python monimage.jpg -o -s
    affiche et sort un fichier csv avec les données de l'histogramme

    je n'ai testé qu'avec des jpg...
    cordialement

  7. #7
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    Par défaut
    On ne doit utiliser que la bibliothèque PIL
    Merci quand même pour ta réponse =)

  8. #8
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    Citation Envoyé par josmiley Voir le message
    tu n'as pas le droit d'écrire dans le répertoire courant ...
    Ou le fichier existe en lecture seule pour vous.
    Un test simple pour cela:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    fout=open( "test1.csv", "w")
    Ou avec le module os:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    if os.access("test.csv", os.W_OK):
        fout=open( "test.csv", "w")
        for i in range (0,60):
            output = str(cc)+"\t"+str(i)+"\n"
            fout.write (output)
        fout.close()
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    if os.access("test.csv", os.W_OK):
        with open( "test.csv", "w") as fout:
            for i in range (0, 60):
                fout.write(str(cc)+"\t"+str(i)+"\n")
    Il est toujours possible de passer par try plutôt qu'os:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    try:
        fout = open("test.csv", "w")
    except IOError:
        print('Interdit')
    else:
        with fout:
            for i in range (0, 180):
                fout.write(str(cc)+"\t"+str(i)+"\n")
    @+
    Merci d'utiliser le forum pour les questions techniques.

  9. #9
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    Par défaut grr
    si tu avais pris la peine de lire un peu mieux ma réponse et donc mon message, tu aurais compris qu'il y a deux possibles. tu peux enlever l'utilisation de matplotlib et simplement sortir les valeurs en csv de tes intensités en omettant completement l'import de matplotlib et de la condition sur l'argument -s.

  10. #10
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    Par défaut
    Ah désolé utopman je pensais qu'il fallait utiliser les deux ( je ne suis tellement pas douée en Python que j'ai même pas su le reconnaître qu'on pouvait faire qu'avec un ^^)
    Mais mon image est en noir et blanc du coup je ne peux pas la découper par bandes r,v,b si ?


    PauseKawa : quand j'utilise ce que vous me proposez je n'ai plus de message d'erreur mais j'obtiens un fichier avec deux colonnes une qui varie entre 1 et 60 et l'autre qui reste bloquée à 158 alors que mes résultats sont complètement différents, comment ça se fait ?

  11. #11
    Expert confirmé Avatar de PauseKawa
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    Par défaut
    Bonjour,

    L'erreur ne viens pas de mon code (qui ne concerne que l'écriture du fichier) mais du votre:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    for i in range (0,60):
        output = str(cc)+"\t"+str(i)+"\n"
        fout.write (output)
    Ici seul i change, cc reste à la dernière valeur que vous lui avez donner (158).

    @+
    Merci d'utiliser le forum pour les questions techniques.

  12. #12
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    Par défaut
    Ah oui c'est bon ça marche merci pour votre aide =)

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