Discussion :

[shadow19c]

Bonjour,
j'ai un fichier qui contient un couple CV-*** Aster-*** et des distances

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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C169v2-04488	Aster-06787	68.42	76	24	0	187	262	561	636	8e-30	 125
C169v2-04488	Aster-02687	28.35	127	81	4	38	154	301	427	0.024	34.3
C169v2-04487	Aster-06725	28.38	148	96	4	92	235	216	357	8e-08	52.4
C169v2-04487	Aster-00105	38.30	47	29	0	36	82	731	777	0.25	30.8
C169v2-04487	Aster-06545	22.54	142	94	3	23	151	507	645	0.55	29.6
C169v2-04487	Aster-05903	31.91	47	29	1	97	143	283	326	1.6	28.1
C169v2-04480	Aster-06724	60.66	61	24	0	371	431	4	64	3e-14	74.7
C169v2-04480	Aster-02153	23.93	305	183	9	34	319	71	345	3e-05	44.7
C169v2-04480	Aster-06101	25.00	248	161	8	14	254	1926	2155	0.001	39.3
C169v2-04480	Aster-06101	23.48	132	83	3	117	230	438	569	3.3	28.1
C169v2-04480	Aster-01563	26.90	145	93	3	117	261	586	717	0.007	37.0
C169v2-04480	Aster-03475	23.97	292	202	8	45	330	549	826	0.012	36.2
C169v2-04480	Aster-01708	22.73	286	166	8	60	306	214	483	0.021	35.4

Et j'ai un autre fichier contenant le couple CV-*** Aster-***:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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C169v2-04488	Aster-06787
C169v2-04487	Aster-06725
C169v2-04480	Aster-06724

Je dois a partir du deuxieme fichier "test.txt" aller recuperer les distances respectifs des couples,car comme vous pouvez le voir je ne peux pas regarder que CV-*** car il y a des CV-** qui reviennent souvent donc je dois me baser au couple CV-*** Aster-***, exemple:
C169v2-04488 Aster-06787 distance 187 262 561 636
C169v2-04487 Aster-06725 92 235 216 357
C169v2-04480 Aster-06724 371 431 4 64

Voici mon code mais j'ai un souci car j'arrive pas a lui dire qu'il faut la cle CV-*** Aster-**** puis recuperer dans le deuxieme fichier les distances:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#! /usr/bin/python
 
 
#coding=utf-8
d1,d2={},{}
with open('test.txt') as fichier:# ouverture du fichier coco_aster, lecture de chaque ligne et comparaison des doublons....
  	   for line in fichier:
     		  cv, aster = line.split('\t')[:2]
		  d1[aster] = cv
 
with open('coco_aster.txt') as fic:
	for line in fic:
		ok=line.split('\t')[1:2]
 
 
print d1.keys()

Merci , si vous avez une idee de comment faire car la je suis perdu

[shadow19c]

Bonjour,
j'ai modifie un tout petit peu mon code mais j'arrive pas a aller chercher la correspondance des Aster, et mettre la bonne distance:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#! /usr/bin/python
 
 
#coding=utf-8
d1,d2,d3={},{},{}
with open('test.txt') as fichier:
		  for line in fichier:	
     		 	 cv, aster = line.split('\t')[:2]
		  	 d1[cv] = aster
 
 
 
with open('coco_aster.txt') as fic:
	for line in fic:
		cv1=line.split('\t')[0:1]
		psositon=line.split('\t')[6:10]
		for i in d1.keys():
			if cv1 ==i:
				print i

[Simpom]

Bonjour.

Si j'ai bien tout compris, tu cherches à obtenir les valurs des 4 colonnes qui t'intéressent pour chaque couple (CV-Aster).

Je te propose :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#! /usr/bin/python
 
# Obtention des couples (CV-Aster) du fichier test
result = {}
fichier = open('test.txt')
for line in fichier:
	line = line.replace('\n','')
	cv, aster = line.split('\t')[:2]
	result[cv,aster]=[]
 
# Obtention des valeurs pour les couples recherches
fic = open('coco_aster.txt')
for line in fic:
	line = line.replace('\n','')
	data = line.split('\t')
	key = (data[0],data[1])
	if key in result.keys():
		result[key] = [float(data) for data in data[6:10]]
 
# Affichage des resultats
for key,value in result.items():
	print key,':',value

Et le résultat obtenu :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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('C169v2-04480', 'Aster-06724') : [371.0, 431.0, 4.0, 64.0]
('C169v2-04487', 'Aster-06725') : [92.0, 235.0, 216.0, 357.0]
('C169v2-04488', 'Aster-06787') : [187.0, 262.0, 561.0, 636.0]

Est-ce ce que tu cherchais ?
Bonne journée !

[shadow19c]

Oui, merci
mais je voulais savoir je voulais qu'il n y est pas les () et les , dans quelle partie je dois changer.

Merci