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Hibernate, c'est très bien pour le mapping O/R...
Pense peut-être aux JavaServerFaces j'ai peu de connaissances à ce sujet, mais je sais que l'architecture de ce Framewok est plus flexible que...

Cela dépend de ce que tu comptes faire avec cette application...
MYSQL pour une application de haut volume transactionnel... il convient d'examiner les DBMS à Notre disposition:

Oracle
DB2 d'IBM...

d'abord.....
tes connaissances en la matière, quelles sont-elles ?
Un petit yutoriel Struts t'aiderait sûrement :)
tu as déjà un plugin pour ajax sous Eclipse ?

dans l'attente de plus...