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C'est souvent tout à fait justifié, j'utilise moi même très souvent plusieurs bases (une par produit / module). Mais ne pas pouvoir faire de jointures, ça remets effectivement en cause le modèle.

Ah, dommage. Tu l'as dans l'os, tu vas devoir faire une croix sur les jointures inter-bases alors :(

Et du coup oui, tu vas devoir ouvrir deux connexion et émuler les jointures en PHP. Pas cool du...

Non ce serait stupide, autorise les select pour l'utilisateur ce sera plus logique.

C'est tout à fait ça. S'il y a des problèmes de conflits avec des mots clés SQL, on peut échaper tout ça avec des backquotes (ce que je fais systématiquement désormais pour m'éviter les problèmes).
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