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Ok, J'éviterais donc les NA dorénavant lorsque j'aurais des doutes

Merci à vous.

Ok, mais alors pourquoi arrive-t-il à dessiner les barres vertes, qui correspondent à B[1,] ?

Voici le programme suivant :
A=rbind(c(1,0,0,0,0,1),c(0,0,0,2,1,2))
B=rbind(c(1,NA,NA,NA,NA,0.9),c(NA,NA,NA,1.8,0.8,1.7))
barplot(A,col=c('blue','red')) #barres verticales bleues et rouges...