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Si tu utilises awk, c'est quand même plus propre de tout faire en awk :

awk -F ' ' '/TOTAL ETABLISSEMENT/ { if ($4 != $5) { print "balance pas ok"; exit } }

Sinon tu récupère simplement des nombres dans deux variables avec un truc du genre "read junk junk junk n1 n2", puis tu fais une comparaison de chaines entre $n1 et $n2: [[ $n1 = $n2 ]]