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Si tu veux faire ça, tu dois faire des conditions, ça donnera grossièrement un truc du genre :

while ( my $titre = <FICHIER_SEQUENCES> ) { #c'est là où sont stockées les séquences que tu...

Si je comprends bien, tu veux traiter des trucs et écrire les résultats dans un fichier dédié.
Ce n'est pas une bonne idée de créer le fichier dans la boucle, mais en-dehors. En fait, si tu le crées...

Salut et bienvenu,

C'est quoi exactement la question? :aie: