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vnc c'est par défaut pas sécurisé, tous les flux passent en clair sur le réseau.
SSH ça a l'avantage de tout faire passer dans un tunnel crypté.

1) c'est normal tu n'as pas de serveur ssh sur ta machine windows, tu n'en as que sur la machine linux
2) Et même si t'avais un serveur ssh sur la machine windows la commande serait celle-ci :

...

Non.
Le serveur X est exécuté sur ta machine windows.
Fluxbox sera exécuté sur le serveur distant (la machine linux)
Donc en gros tu démarres un serveur X sur ton poste windows et une session...

Alors en fait je viens de tester un truc sympa :)
J'ai réussi à démarrer une session fluxbox à distance en utilisant ssh.

Pour ce faire j'ai simplement crée dans mon home directory un fichier...

Non
C'est un programme à part




scp repertoire_ou_se_trouve_le_fichier/fichier_a_copier utilisateur@serveurlinux:repertoire_destination/

Pour copier le contenu d'un repertoire et de ses...

Je dirais qu'il vaut mieux copier tes scripts sur le serveur. A moins d'avoir fait un partage sur ta machine windows et de monter ce partage sur ton serveur linux (smbclient, smbmount...) Mais quoi...

Ben vérifier alors que sur le serveur tu as la ligne suivante dans le /etc/ssh/sshd_config


X11Forwarding yes


et se connecter en faisant un
ssh -X machine_distante à partir du client

Putty n'est qu'un terminal qui permet de se connecter en telnet et ssh sur une machine distante.
http://fr.wikipedia.org/wiki/PuTTY

Je dirais que cygwin est un "portage" de nombreux outils...