Discussion :

[marie_87]

J'ai créé un network à partir d'un fichier csv en utilisant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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adj_mat = np.loadtxt("outputsnet/output.csv",delimiter=',',skiprows=0)
net = nx.from_numpy_matrix(adj_mat, create_using=nx.DiGraph())

Et quand je tape:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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w=net.edges(data=True)
print w

j'obtiens:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

[(51, 92, {'weight': 589.0}), (51, 95, {'weight': 579.0}), (53, 82, {'weight': 644.0}), (56, 83, {'weight': 644.0}), (58, 93, {'weight': 589.0}), (59, 84, {'weight': 644.0}), (62, 96, {'weight': 579.0}), (64, 97, {'weight': 579.0}), (65, 89, {'weight': 599.0}), (65, 98, {'weight': 579.0}), (66, 99, {'weight': 579.0})]

Mon problème est que lorsque je veux calculer le eigenvector centrality du réseau en écrivant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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centrality = nx.eigenvector_centrality(net,weight='weight')
print(['%s %0.2f'%(node,centrality[node]) for node in centrality])

j'obtiens tous les poids à 0:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

['64 0.00', '65 0.00', '66 0.00', '99 0.00', '51 0.00', '97 0.00', '96 0.00', '98 0.00', '82 0.00', '83 0.00', '84 0.00', '53 0.00', '56 0.00', '89 0.00', '58 0.00', '59 0.00', '92 0.00', '93 0.00', '62 0.00', '95 0.00']

Je n'ai pas compris pourquoi les poids que j'ai passés ne sont pas considérés.

Quelqu'un pourrait-il m'aider la-dessus ?

[wiztricks]

Salut,

Je n'ai pas compris pourquoi les poids que j'ai passés ne sont pas considérés.

Quelqu'un pourrait-il m'aider la-dessus ?

Probablement parce qu'il y a peu ou pas de connections entre les différents nœuds.

- W

[marie_87]

Bonjour wiztricks, Merci pour votre réponse.
C'est ce que je ne comprends pas, car quand je tape:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

net.nodes()

j'obtiens la liste de tous mes noeuds

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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[51,
 53,
 56,
 58,
 59,
 62,
 64,
 65,
 66,
 82,
 83,
 84,
 89,
 92,
 93,
 95,
 96,
 97,
 98,
 99]

et quand je veux afficher la liste des liens, ils sont bien là :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

net.edges()

j'ai ceci:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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[(51, 92),
 (51, 95),
 (53, 82),
 (56, 83),
 (58, 93),
 (59, 84),
 (62, 96),
 (64, 97),
 (65, 89),
 (65, 98),
 (66, 99)]

Il y a détail qui serait peut être intéressant au départ, même si je pense qu'une fois le fichier chargé le réseau est c'est bon: Il s'agit de mon fichier, c'est un fichier contenant des 0 et des valeurs de poids aux indices i,j et donc à la ligne i et à la colonne j on a le poids comme contenu de la cellule. Mais comme je l'ai dit précédemment, j'arrive à avoir mon réseau :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

[(51, 92, {'weight': 589.0}), (51, 95, {'weight': 579.0}), (53, 82, {'weight': 644.0}), (56, 83, {'weight': 644.0}), (58, 93, {'weight': 589.0}), (59, 84, {'weight': 644.0}), (62, 96, {'weight': 579.0}), (64, 97, {'weight': 579.0}), (65, 89, {'weight': 599.0}), (65, 98, {'weight': 579.0}), (66, 99, {'weight': 579.0})]

[wiztricks]

Salut,

J'avais vu que vous avez une liste de nœuds et de edges non vides. Ce que je vous dis c'est que vos noeuds sont loin d'être reliés entre eux: votre graphe est composé de nombreux graphes disjoints.... et pour parler de centralité d'un nœud, il faut quand même qu'il y ait des chemins/edges qui permettent d'y accéder.

- W

[marie_87]

Ah oui c'est vrai, je n'avais pas remarqué ça.
Merci beaucoup pour votre aide