Lancer un fichier matlab en batch

**Stepsbysteps** · 14/03/2013, 10h56

Bonjour,

J'essaye de lancer un fichier matlab par un fichier batch pour ensuite lancer un programme R.

J'ai essayé pour la partie Matlab de faire

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2010b\bin\matlab.exe" -r "c:\temp\Main_tirage.m"

Matlab se lance mais pas le code.

Si quelqu'un peux m'aider merci

**Jerome Briot** · 14/03/2013, 11h19

Comme ceci :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2010b\bin\matlab.exe" -sd "c:\temp" -r "Main_tirage"

**Stepsbysteps** · 14/03/2013, 11h30

Merci, en faite je l'avais mis dans temp pour raccourcir seulemnt il est dans un autre répertoire avec des espaces dans le chemin du genre :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"D:\modelisation Matlab_gestion de la base de données\Backtesting_modèle_Logit\Matlab"

Et ça ne passe plus

**Stepsbysteps** · 14/03/2013, 11h46

Pour tester j'ai déplacé les fichiers qui étaients liés aux main dans temp, matlab se lance mais reste sur Initialising...

**Jerome Briot** · 14/03/2013, 14h58

Ben, oui mais même si ça semble un peu ringard, ne pas utiliser d'espace, de caractères spéciaux ou de caractères accentués dans les noms de fichiers et de dossier, ainsi que des noms courts font quand même partie des bonnes pratiques de programmation.

Sinon, as-tu essaié avec un script tout simple qui ne fait qu'afficher une phrase ?

Par exemple :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

disp('Hello World !')

**Stepsbysteps** · 14/03/2013, 15h31

Autant pour moi ça marche.
Merci vous êtes au top, il faut revenir sur ses basique.

Next level: Lancer le bat mais pas avoir matlab d'ouvert visuellement?

**Jerome Briot** · 14/03/2013, 15h42

Envoyé par Stepsbysteps

Next level: Lancer le bat mais pas avoir matlab d'ouvert visuellement?

Tu ne pourras pas te passer de l'ouverture de MATLAB.

Au mieux :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2010b\bin\matlab.exe" -nodesktop -minimize -nosplash -sd "c:\temp" -r "Main_tirage"

Tu peux aussi utiliser le -nojvm selon l'utilité ou non des outils Java.

Voir l'impact que cela a sur la quantité de mémoire au démarrage : Memory (part2)

**Stepsbysteps** · 14/03/2013, 15h47

Super merci beaucoup!

**Stepsbysteps** · 14/03/2013, 17h07

Ok, en faite maintenant dans mon bacth je lance un second programme avec un autre logiciel mais il doit se lancer à la fin du 1er ce qui n'est pas le cas pour l'instant.

Comment puis-je remédier à ça?

**Jerome Briot** · 14/03/2013, 17h47

Essaie en remplaçant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2010b\bin\matlab.exe"

simplement par

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

matlab

Je en me rappelait plus que l'option -sd n'était plus supportée...

Dans ce cas la ligne suivante :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

"C:\Program Files (x86)\MATLAB\R2010b\bin\matlab.exe" -nodesktop -minimize -nosplash -sd "c:\temp" -r "Main_tirage"

devient

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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2
3
cd "c:\temp"
 
matlab -nodesktop -minimize -nosplash -r "Main_tirage"

**Stepsbysteps** · 15/03/2013, 09h27

Bonjour,

Merci en faite il fait toujours ma 2ème commande quand matlab se lance,
j'ai enlevée les options :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

-nodesktop -minimize -nosplash

Pour bien voir ce qu'il se passe.

Le 1er programme me sort un fichier texte, le deuxième le traite et en faite quand je lance le batch le 2ème programme traite l'ancien fichier texte créee lors d'une précédente manipulation.

**Jerome Briot** · 15/03/2013, 10h30

Effectivement, il ne semble pas y avoir de solution simple à ce problème.

Pourrais-tu nous expliquer précisément ce que tu fais, quelles sont les étapes et les lignes de commandes que tu souhaites effectuer ?

**Stepsbysteps** · 15/03/2013, 13h27

J'effectue un tirage avec Matlab sur un gros fichier de données et je traite ce fichier avec R pour une régression logistique.

Du coup je voulais que les deux traitements s'effectue en lançant qu'une opération d'où un batch.

**Jerome Briot** · 15/03/2013, 13h35

Ce que je ne vois pas très bien, c'est pourquoi utiliser une fichier batch

Tu pourrais très bien lancer R depuis MATLAB une fois le tirage effectué.

**Stepsbysteps** · 15/03/2013, 13h45

Ah oui? Il me reste plus qu'à savoir comment alors

**Jerome Briot** · 15/03/2013, 13h59

Jette un œil à la fonction system :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

doc system

**Stepsbysteps** · 15/03/2013, 14h44

Ok merci j'en conclut :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

system('R CMD BATCH infile outfile');

Je joue pour l'instant avec une version portable de R ce qui est assez contraignant car si je comprends bien, le mot clé R ne sera pas répertorié?

Quand au infile, faut-il qu'il soit placer dans le \bin?

J'aimerai un truc sur le bureau ou autre plus simple.

Merci d'avance,
J'en apprends beaucoup avec vous

**Jerome Briot** · 15/03/2013, 15h12

Tu peux faire ceci :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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pathname = 'C:\temp';
infile = fullfile(pathname,'test.R');
outfile = fullfile(pathname,'test.txt');
 
cmd = sprintf('R CMD BATCH %s %s', infile, outfile);
 
system(cmd)

C'est l'idée, à toi de l'adapter.