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Vieux 07/09/2012, 15h06   #1
nogaro
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Par défaut retrouver seq nucleotide dans fichier initial apres tblastn local

Bonjour,

Voici une question de béotien. Je viens de faire un tblastn local (standalone blast) afin d'identifier des gènes dans la sequence d'un génome que j'ai converti en base de données locale avec makeblastdb.

Mes queries étaient des séquences proteiques correspondant aux genes recherchés et elles ont bien été identifiées dans la sequence de mon genome "traduite en séquence protéique" grace au tblastn.

J'ai par contre beaucoup de mal a retrouver ces sequences dans mon génome "non traduit" (fichier initial). Y a t-il un moyen facile de retrouver ces sequences a partir du fichier resultat de mon tblastn ?

Merci par avance et désolé si cette question a déjà ete traitée ici mais je n'ai pas su trouver avec l'outil recherche.
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