Discussion :

[Thomas77380]

Bonjour à tous,

je dois intégrer un script python au coeur d'un code java en utilisant ceci:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

String [] cmd2 = new String[]{commande python, arguments = X Y)};

A l'aide de cette commande 2 je dois pouvoir importer mon script python puis lui passer mes différents arguments (X,Y ect....) cependant je n'ai aucune idée de la manière dont je dois importer ce script, je pensais faire un "import nom_de_mon_script" mais dans la partie "commande python" je met quoi ?
Le script en python est une fonction permettant l'affichage de motifs en prenant 2 arguments en entrée.

[laurent_m]

Pas très claire comme question

Peut-être voir au niveau de JYton qui est une Saveur de python dont le code peut rouler sur la VM JAVA

[Thomas77380]

En fait peu importe la méthode j'aimerai pouvoir executer mon script python, j'ai lu quelque tuto sur Jython et j'ai peur que ce soit trop complexe, n'y aurait'il pas une autre solution ?

[thelvin]

Euh... Java c'est pour programmer en Java, hein... On peut appeler des scripts en d'autres langages, mais la liaison est un peu compliquée, forcément.
Surtout que Python n'est pas un des langages de scripts intégrés à Java.

[Thomas77380]

Donc je peux abandonner l'idée d'importer mon script Python dans mon code java ?

[thelvin]

Comme tu veux, mais... Tu trouveras pas plus simple que Jython.

Juste pour info : une fois que la bibliothèque Jython est en place, ça peut s'appeler comme ça : http://wiki.python.org/jython/UserGuide#using-jsr-223

[Thomas77380]

merci pour votre réponse, je viens d'installer Jython à l'instant, les seules librairies dont j'ai besoin sont donc celles de l'exemples :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.script.ScriptException;

?

Le problème c'est que dans mon fichier java il n'y a pas de main (alors que c'est à l'interieur de celui ci qu'on appel notre script si j'ai bien compris).

Voici l'extrait du code ou j'aimerais appeler mon script :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getInputStream()));
						String line = "";
						setOutput("");
						try {
							while((line = reader.readLine()) != null) {
								/** Outpuut stream processing of miRNAFold **/
								Rrrr R1 = new Rrrr(line);
								PyhtonScriptInterpreter interpreter = new PyhtonScriptInterpreter();
								String motifs = interpreter.executeScript("alignement_final.py " + R1.getresult());
								//String [] cmd2 = new String[]{      ,R1.getresult()};
								 motifs = getOutput2();
								setOutput( getOutput()+"<br>"+line+"<br>"+ getOutput2());
							}
						} finally {
							reader.close();
						}
					} catch(IOException ioe) {
						ioe.printStackTrace();
					}

Je fais appel a ma classe Rrrr qui me permet de récupérer des arguments que j'aimerai ensuite passer a mon script python pour qu'il s'execute et qu'il me renvoie des résultats (getoutput2).

Je vais modifier ma ligne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 PyhtonScriptInterpreter interpreter = new PyhtonScriptInterpreter();

qui est inutile, mais je voulais vous montrer la stratégie que je voudrais employer (globalement).


EDIT : en fait je pense que l'importation devrait se faire dans ma classe Rrrr directement je pense, là où se situe mon main, voici cette classe (je viens d'y importer les différentes librairies):

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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package paquet;
import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.script.ScriptException;
 
 
public class Rrrr {
 
	/**
         * @param args
         * 
         * 
         **
         */ 
	private String positionDebut; 
	private String positionFin;
	private String Fin;
 
	public Rrrr (String ligne){
 
 
 
 
		String[] valeur = ligne.split(" ");  
 
		if (valeur.length >= 3) {
		   this.positionDebut=valeur[0];
		    this.positionFin=valeur[1];
		    this.Fin = valeur[valeur.length - 1];
		}
 
		}
 
	  public String getresult(){
 
		 String result = this.positionDebut + " " + this.positionFin + " "+  this.Fin ;
		  return result;
 
	  }
 
	public static void main(String[] args) {
 
 
 
 
		//String ligne ="53 130 + [-27.3] ((((.(.(((((((.((..((((.........(((..(((....))).)))...))))..)).))))))).)..)))";
 
		//Rrrr test = new Rrrr(ligne);
 
}
}

Merci encore

[Thomas77380]

Mon cas est un peu compliqué en fait, je voudrais savoir si quelqu'un avait déjà réussis a importer un simple script python dans son code java et a le faire tourner, et si oui la procédure qu'il a utilisé car je suis le tutoriel suivant:
http://wiki.python.org/jython/UserGuide#using-jsr-223

seulement je ne vois pas l'importation d'un script mais plutôt la définition d'un script même a l'intérieur du code, de plus lorsque j'essaie d'exécuter ce code je reçois le message d'erreur suivant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException

apparemment le import sys ne passe pas :/

Bref si quelqu'un possédant une experience de Jython pouvait m'aider