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MATLAB Discussion :

Extraction de donnée XML à l'intérieur d'un fichier DICOM [Débutant]


Sujet :

MATLAB

  1. #1
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    Par défaut Extraction de donnée XML à l'intérieur d'un fichier DICOM
    Bonjour j'ai un soucis avec mon programme sur matlab. Je parcoure le xml à l'aide du DOM ;je recupere des données que j'affiche sur des plans le tout en 3D. J'aimerais appliquer mon programme en utilisant en lecture d'entrée un fichier de type DCM contenant des champs et dans un de ses champs se trouve ce fichier xml qui m'etait donné séparément . J'arrive à ouvrir le fichier DCM à partir de matlab mais les fonctions de la méthode DOM ne fonctionnenent pas , dont j'aimerais qu'on m'aide pour la lecture du fichier DCM de telle sorte que les fonctions du DOM puissent s'appliquer après sur xml qui est intégré dans un champ du fichier DCM.

    voilà mon programme qui me permet de lire le fichier DCM et d'afficher tous ses champs, le xml est contenu dans le champ(Private_0867_1003)

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    clear ;
    clc;
    %Script d'ecriture sur Les tables de la BD
     
    %Lien du fichier DICOM
    [FileName,PathName] = uigetfile('*.dcm','Sélectionner un fichier DICOM','');
    filename = [PathName,FileName];
     
    url=filename;
    %Lire les tags du fichier DICOM
    Tagdicom=dicominfo(url)
     
    toto=Tagdicom.Private_0867_1003

  2. #2
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    Par défaut
    Essaie ceci :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    [FileName,PathName] = uigetfile('*.dcm','Sélectionner un fichier DICOM','');
     
    Tagdicom = dicominfo(fullfile(PathName,FileName));
     
    fid = fopen('data.xml','w');
       fwrite(fid,Tagdicom.Private_0867_1003);
    fclose(fid);
    Tu devrais normalement pouvoir exploiter les données contenues dans data.xml

    Si ça n'est pas possible, montre nous ce que renvoie ceci :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    class(Tagdicom.Private_0867_1003)
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  3. #3
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    Par défaut
    Les fonctions du DOM ne marchent toujours pas . voici ce que j'obtiens:
    ans =
    
    char
    
    
    ans =
    
           30420  
    j'aussi remarquer que fid =3 si ça peut vous aider
    mais toutefois le Tagdicom est bel te bien ouvert avec tous ses champs. mais les fonctions du DOM ne s'appliquent pas au xml .

  4. #4
    Rédacteur/Modérateur

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    Par défaut
    Le contenu du fichier data.xml est-il correcte ?
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  5. #5
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    Par défaut
    oui il est correct. car en ajoutant toto=Tagdicom.Private_0867_1003; dans le code plus haut j'obtiens bel et bien le contenu du xml. Mais les fonctions du DOM ne s'appliquent pas .

  6. #6
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    Par défaut
    Citation Envoyé par liogo Voir le message
    Mais les fonctions du DOM ne s'appliquent pas .
    Tu pourrais être plus précis...

    Quelle fonction utilises-tu pour lire le XML ?
    MATLAB renvoie-t-il un message d'erreur ?

    Pourrais-tu attacher un fichier XML (dans une archive zip ou rar) si tes données ne sont pas confidentielles ?
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  7. #7
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    Par défaut
    voici le debut de mon programme quand je code a partir du xml :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    DOMnode = xmlread('3D14infos.xml');
    xRoot = DOMnode.getDocumentElement;
    allPILEPRIMITIVES = DOMnode.getElementsByTagName('PILEPRIMITIVE');
    allPILEPRIMITIVES2 = DOMnode.getElementsByTagName('REGLE3D');
    et voici le message d'erreur que matlab me genere apres avoir essayé de coder a partir du fichier DCM:


    ??? Attempt to reference field of non-structure array.
    
    Error in ==> essai at 33
    xRoot = DOMnode.getDocumentElement;
    les données sont confidentielles, merci pour votre aide.

    pour ouvrir le xml a partir du fichier DCM j'utilise:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    DOMnode = xml_parseany(Tagdicom.Private_0867_1003);

  8. #8
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    Par défaut aide merci
    MErci j'ai reussi grace a ce que vous m'avez dit juste une deniere question dites moi j'ai reussi a lire le data.xml en utilisant xmlreal comment faire pour le supprimer juste apres la lecteure car pr des besoins confidentielles le xml ne doit pas etre vu par le client .

  9. #9
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