Essaye de lancer ta 'compilation' non pas à partir de la console, mais d'un *. bat
Au pire inclut le chemin de python.exe, setup.py et py2exeCode:
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3python.exe setup.py py2exe -b 2 pause
Cette méthode fonctionne parfaitement sous python 2.4
Le pause dans le *.bat te permettra aussi de lire l'ensemble des opérations réalisées durant la 'compilation'