Installation de packages R dans une image Docker
Bonjour à toutes et à tous,
Je tiens tout d'abord à souligner que je suis un grand novice en R. Désolé si ma question est simplette.
Je lance des calculs avec un code R sur un serveur de calcul. Pour se faire, j'ai un script R qui est chargé dans une image docker qui est ensuite envoyée sur le serveur de calcul. Dans ce script R j'installe des packages, typiquement:
Code:
1 2 3 4 5
| install.packages("lme4")
install.packages("dplyr")
install.packages("Matrix")
install.packages("parallel")
install.packages("rsq") |
Et ca fonctionne très bien.
Par contre, j'ai un soucis avec l'installation d'un autre package:
Code:
1 2 3 4 5 6 7
| install.packages("LongituRF")
install.packages("caret")
install.packages("party")
library("dplyr")
Error in library(LongituRF) : there is no package called LongituRF
Execution halted |
A noter que le code fonctionne en local sur ma machine, et que les packages sont bien installés comme ça devrait l'être. Par contre quand j’exécute ce script R via l'image docker sur laquelle il est installé, ca me met cette erreur. Pouvez-vous m'aiguiller? Je ne sais pas trop ou chercher. J'ai essayé d'inclure une URL pour aller chercher le package, par exemple:
Code:
install.packages('LongituRF', dependencies = TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')
mais sans plus de succès...
Merci!