bonjour,
je veux le programme Blast ou un programme d'alignement locale de séquence en C ou C++.
est-ce que vous pouvez m'aider?
merci
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bonjour,
je veux le programme Blast ou un programme d'alignement locale de séquence en C ou C++.
est-ce que vous pouvez m'aider?
merci
Je ne fais pas de biologie ni de génétique en Perl, mais pour Blast/Bioperl, jette déjà un coup d'oeil à ces liens:
http://www.bioperl.org/wiki/BLAST
http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page
j'ai besoin en code source en C si c'est possible.
car je programme en C.
Dans ce cas, je crains que tu ne sois pas sur la bonne rubrique du forum! :?
Non pas que l'on refuse de t'aider, mais je doute que quiconque ici fasse de l'alignement de séquence en C.
Essaie la rubrique C du site, mais tu n'y trouveras peut-être pas beaucoup de biologistes....
Tu ne peux pas utiliser l'interface web du NCBI ?
Il me semble que j'avais programmé en perl le traitement de requêtes au serveur à l'aide de WWW::Mechanize
Mais ça ne répond pas directement à ta question.
En tout cas, je ne vois guère l'intérêt de programme en C/C++ des applications bio de gestion de génome... vu la puissance expressive de perl et la modulographie disponible dans ce domaine.