Exploiter un .c sur Mac

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04/07/2014, 10h51
Timy123

Exploiter un .c sur Mac

Bonjour,

j'ai récupéré un dossier Matlab qui contient des fichiers écrits en C et qui sont appelés grâce à la fonction dos.
Le problème c'est que je suis sur Mac, et si j'ai bien compris cela ne marche pas aussi bien, en tout cas chez moi ça ne marche pas. :P

J'ai un peu fouillé partout, et j'ai du mal à trouver mon bonheur. Certains bidouillent sans que je comprenne quoi que ce soit, et j'ai beau avoir tenté les mex -setup ou autre, je n'aboutis à rien. Le message d'erreur à la base de tout serait celui-ci :

/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/mex: line 305: gcc-4.2: command not found
/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/mex: line 1326: gcc-4.2: command not found

Je suis un peu perdu, apparemment il faudrait installer un patch (et je n'ai absolument aucune idée de comment faire, et le seul tuto sur internet que j'ai trouvé m'est incompréhensible… :( ) mais de toute façon sur le site mathworks il s'arrête aux versions 4.5 de Xcode quand j'ai la version 5.1.

Je vous remercie infiniment si vous pouvez m'éclairer.

Bon, la situation a évolué.

J'ai suivi ce tuto :
http://audioplastic.org/blog/2014/02...ons-of-matlab/

Et la compilation marche, j'ai un fichier.o qui est créé mais la dernière étape plante. Certains symboles ne seraient pas reconnus :

Code:

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  ----------------------------------------------------------------
->    MATLAB                = /Applications/MATLAB_R2012a.app
->    CC                    = llvm-gcc
->    CC flags:
         CFLAGS             = -fno-common -no-cpp-precomp -arch x86_64 -isysroot /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.9.sdk -mmacosx-version-min=10.9 -fexceptions
         CDEBUGFLAGS        = -g
         COPTIMFLAGS        = -O2 -DNDEBUG
         CLIBS              = -L/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/maci64 -lmx -lmex -lmat -lstdc++ -framework Accelerate
         arguments          =  -DMX_COMPAT_32
->    CXX                   = llvm-g++
->    CXX flags:
         CXXFLAGS           = -fno-common -fexceptions -arch x86_64 -isysroot /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.9.sdk -mmacosx-version-min=10.9
         CXXDEBUGFLAGS      = -g
         CXXOPTIMFLAGS      = -O2 -DNDEBUG
         CXXLIBS            = -L/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/maci64 -lmx -lmex -lmat -lstdc++ -framework Accelerate
         arguments          =  -DMX_COMPAT_32
->    FC                    = gfortran
->    FC flags:
         FFLAGS             = -fexceptions -m64 -fbackslash
         FDEBUGFLAGS        = -g
         FOPTIMFLAGS        = -O
         FLIBS              = -L/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/maci64 -lmx -lmex -lmat -L -lgfortran -L -lgfortranbegin
         arguments          =  -DMX_COMPAT_32
->    LD                    = llvm-gcc
->    Link flags:
         LDFLAGS            = -Wl,-twolevel_namespace -undefined error -arch x86_64 -Wl,-syslibroot,/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.9.sdk -mmacosx-version-min=10.9 -bundle -Wl,-exported_symbols_list,/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/lib/maci64/mexFunction.map
         LDDEBUGFLAGS       = -g
         LDOPTIMFLAGS       = -O
         LDEXTENSION        = .mexmaci64
         arguments          = 
->    LDCXX                 = 
->    Link flags:
         LDCXXFLAGS         = 
         LDCXXDEBUGFLAGS    = 
         LDCXXOPTIMFLAGS    = 
         LDCXXEXTENSION     = 
         arguments          = 
----------------------------------------------------------------
 
-> llvm-gcc -c  -I/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/include -I/Applications/MATLAB_R2012a.app/simulink/include -DMATLAB_MEX_FILE -fno-common -no-cpp-precomp -arch x86_64 -isysroot /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.9.sdk -mmacosx-version-min=10.9 -fexceptions  -DMX_COMPAT_32 -O2 -DNDEBUG  "EP.c"
 
-> llvm-gcc -O -Wl,-twolevel_namespace -undefined error -arch x86_64 -Wl,-syslibroot,/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.9.sdk -mmacosx-version-min=10.9 -bundle -Wl,-exported_symbols_list,/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/lib/maci64/mexFunction.map -o  "EP.mexmaci64"  EP.o  -L/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/maci64 -lmx -lmex -lmat -lstdc++ -framework Accelerate
 
Undefined symbols for architecture x86_64:
  "_Alloc2D", referenced from:
      _refreshInitMemory in EP.o
      _getNextLevelOfNullPlaneCurves in EP.o
  "_Alloc3D", referenced from:
      _refreshInitMemory in EP.o
  "_getDistanceMatrixFromCurveUsingMinMax", referenced from:
      _main in EP.o
  "_getDistancePointLineSegment", referenced from:
      _getDistanceMatrixFromCurve in EP.o
  "_mexFunction", referenced from:
     -exported_symbol[s_list] command line option
  "_printfMinMaxSolutions", referenced from:
      _printDataForMatlab in EP.o
  "_runApprEQP", referenced from:
      _mainAlgoOfEP in EP.o
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
 
    mex: link of ' "EP.mexmaci64"' failed.

J'ai l'impression que les cases vides à la fin, c'est mauvais signe :aie: , mais je ne sais pas vraiment quoi y mettre. :)

04/07/2014, 13h45
Jerome Briot

Pourrais-tu nous montrer l'ensemble des messages renvoyés par MATLAB lors de la compilation ?

Effectivement j'ai omis une partie du message. :oops:

 Warning: Neither -compatibleArrayDims nor -largeArrayDims is selected. 
           Using -compatibleArrayDims. In the future, MATLAB will require
           the use of -largeArrayDims and remove the -compatibleArrayDims
           option. For more information, see:
           http://www.mathworks.com/help/techdo...bsflnue-1.html

Tout le reste a déjà été cité plus haut.

Suis-je censé voir autre chose ?

04/07/2014, 14h12
Jerome Briot

Il faudrait nous en dire un peu plus sur ces codes C

Tu parles de DOS dans ton premier message. Ces codes C utilisent peut être des commandes spécifiques à Windows ?
N'y a-t-il pas un fichier d'explications fourni avec ces codes ?

Où les as-tu trouvés ?
Où peut-on les télécharger ?
04/07/2014, 14h25
Timy123
Voilà où j'ai récupéré le code :
http://www.mathworks.com/matlabcentr...-and-modelling

Le code C, ce n'est pas ma tasse de thé, et si tu récupères le code tu verras qu'il fait au cumulé 5000 bonnes lignes :lol: , je n'ai donc pas beaucoup d'idées sur son contenu..

Sur le lien, il dit :
Files:
runEPModelSelection.m: scipt that implements the method
The runEPModelSelection.m calls the EP.exe.
EP.exe can be created by compliling the .c files that are included in the same folder as .m files.
Otherwise, you can download EP.exe from https://dl.dropboxusercontent.com/u/11081708/ep.rar

Dans le script en question, là il utilise la fonction dos ainsi :
Code:

1 2 3 command = sprintf('ep %s %d data\\ epRes_signal4SegN1-noise',fileD,N); dos(command)
où ep est le nom du programme en C et epRes_signal4SegN1-noise est un fichier .txt

En espérant que cela puisse t'éclairer. :)

Bonjour,

je me permets à nouveau de répondre sur cette discussion, bien que mon problème ait légèrement changé.
Je cherche toujours à vouloir tester ce fameux code dont j'ai fourni le lien plus haut. Je me suis fait à l'idée que ce code ne serait pas vraiment compatible pour un Mac, donc j'ai été récupérer un PC, un Matlab et j'ai tenté.
Et j'ai un nouveau message d'erreur à propos de la librairie kernel32.

Je cite Matlab :

Code:

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LINK : fatal error LNK1181: cannot open input file 'kernel32.lib' 
 
  C:\PROGRA~1\MATLAB\R2013A\BIN\MEX.PL: Error: Link of 'EP.mexw64' failed. 
 
Error using mex (line 206)
Unable to complete successfully.

Et pour le message d'erreur complet :

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-> Default options filename found in C:\Users\Timy\AppData\Roaming\MathWorks\MATLAB\R2013a 
---------------------------------------------------------------- 
->    Options file           = C:\Users\Timy\AppData\Roaming\MathWorks\MATLAB\R2013a\mexopts.bat 
      MATLAB                 = C:\Program Files\MATLAB\R2013a 
->    COMPILER               = cl 
->    Compiler flags: 
         COMPFLAGS           = /c /GR /W3 /EHs /D_CRT_SECURE_NO_DEPRECATE /D_SCL_SECURE_NO_DEPRECATE /D_SECURE_SCL=0 /DMATLAB_MEX_FILE /nologo /MD 
         OPTIMFLAGS          = /O2 /Oy- /DNDEBUG 
         DEBUGFLAGS          = /Z7 
         arguments           =  
         Name switch         = /Fo 
->    Pre-linking commands   =  
->    LINKER                 = link 
->    Link directives: 
         LINKFLAGS           = /dll /export:mexFunction /LIBPATH:"C:\Program Files\MATLAB\R2013a\extern\lib\win64\microsoft" libmx.lib libmex.lib libmat.lib /MACHINE:X64 kernel32.lib user32.lib gdi32.lib winspool.lib comdlg32.lib advapi32.lib shell32.lib ole32.lib oleaut32.lib uuid.lib odbc32.lib odbccp32.lib /nologo /manifest /incremental:NO /implib:"C:\Users\Timy\AppData\Local\Temp\mex_z1q1jU\templib.x" /MAP:"EP.mexw64.map" 
         LINKDEBUGFLAGS      = /debug /PDB:"EP.mexw64.pdb" 
         LINKFLAGSPOST       =  
         Name directive      = /out:"EP.mexw64" 
         File link directive =  
         Lib. link directive =  
         Rsp file indicator  = @ 
->    Resource Compiler      = rc /fo "mexversion.res" 
->    Resource Linker        =  
---------------------------------------------------------------- 
 
 
--> cl  /c /GR /W3 /EHs /D_CRT_SECURE_NO_DEPRECATE /D_SCL_SECURE_NO_DEPRECATE /D_SECURE_SCL=0 /DMATLAB_MEX_FILE /nologo /MD /FoC:\Users\Timy\AppData\Local\Temp\mex_z1q1jU\EP.obj -I"C:\Program Files\MATLAB\R2013a\extern\include" -I"C:\Program Files\MATLAB\R2013a\simulink\include" /O2 /Oy- /DNDEBUG -DMX_COMPAT_32 EP.c 
 
EP.c 
EP.c(931) : warning C4244: 'function' : conversion from 'double' to 'int', possible loss of data 
EP.c(892) : warning C4101: 'i1' : unreferenced local variable 
EP.c(892) : warning C4101: 'i2' : unreferenced local variable 
    Contents of C:\Users\Timy\AppData\Local\Temp\mex_z1q1jU\mex_tmp.rsp: 
  C:\Users\Timy\AppData\Local\Temp\mex_z1q1jU\EP.obj 
 
 
--> link /out:"EP.mexw64" /dll /export:mexFunction /LIBPATH:"C:\Program Files\MATLAB\R2013a\extern\lib\win64\microsoft" libmx.lib libmex.lib libmat.lib /MACHINE:X64 kernel32.lib user32.lib gdi32.lib winspool.lib comdlg32.lib advapi32.lib shell32.lib ole32.lib oleaut32.lib uuid.lib odbc32.lib odbccp32.lib /nologo /manifest /incremental:NO /implib:"C:\Users\Timy\AppData\Local\Temp\mex_z1q1jU\templib.x" /MAP:"EP.mexw64.map"  @C:\Users\Timy\AppData\Local\Temp\mex_z1q1jU\mex_tmp.rsp   
 
LINK : fatal error LNK1181: cannot open input file 'kernel32.lib' 
 
  C:\PROGRA~1\MATLAB\R2013A\BIN\MEX.PL: Error: Link of 'EP.mexw64' failed. 
 
Error using mex (line 206)
Unable to complete successfully.

Evidemment j'ai cherché sur Internet, sans grand succès, certains parlent de compatibilité 32-64 bits, d'autres de chemins d'accès à changer. Dans tous les cas leur solution ne semble pas m'aider (en tout cas pour LE chemin d'accès en question). :(
J'ai vu aussi que quelqu'un avait eu le même problème ici :
http://www.developpez.net/forums/d14...theque-libsvm/

J'ai vérifié les étapes de Dut, et LINKERDIR existe bien, j'ai cherché où était le fichier kernel32.lib et je ne l'ai trouvé que dans des toolbox. :?

J'implore infiniment votre aide pour bien finir mon week-end. :calim2:

Merci par avance. :D

Bonjour,

j'ai progressé avec mon Mac, il suffisait d'utiliser la fonction mex sur tous les fichiers .c que j'avais pour se débarrasser de bon nombre de symboles inconnus de l'architecture.

Ainsi, il ne me reste plus que deux problèmes à régler, qui semblent eux plus communs :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 Undefined symbols for architecture x86_64: "_mexFunction", referenced from: -exported_symbol[s_list] command line option ld: symbol(s) not found for architecture x86_64 clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) mex: link of ' "EP.mexmaci64"' failed.
Concernant la fonction mexFunction, si j'ai bien compris c'est parce que le code C ne contient pas cette fonction que cela ne marche pas. J'ai regardé l'exemple de yprime et des explications sur internet, cela semblait aller tout seul : il me suffit de rajouter cette fonction dans le code. Sauf que le code C que je veux utiliser n'est pas un simple "Hello world !", et j'ai tenté de mettre :
Code:

1 2 void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray*prhs[] )
un peu partout (au début, au début d'un main etc. en remplaçant évidemment le main par mexFunction) sans que cela soit concluant. À chaque fois Matlab me retourne un message d'erreur sur le code C lui-même qui n'est plus valide…

Quelqu'un aurait une idée pour intégrer mexFunction ?
Sauriez-vous ensuite réglez le problème du clang ? Il faudrait peut-être bidouiller dans mexopts.sh mais où ?

Merci d'avance. :)