commande bash depuis python

Bonjour à tous,
Première venue sur le forum, soit merci au créateurs/membres actifs de ce bon site.

J'aimerais depuis l'IDLE de python taper ces commandes bash, comment faire?

export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

Voici ou j'en suis rendu:

os.environ['FREESURFER_HOME'] = "/usr/local/freesurfer"

Merci sincèrement.

Bonsoir,
Une possibilité: utiliser, dans le module os, la méthode popen:
(avec un read() pour la lecture de la sortie)

Code:

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>>> from os import popen >>> sortie=popen("ls") >>> ma_lst = sortie.read() >>> print(ma_lst)

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Je ne mets pas la sortie… Mais l'une des idées est ici…

PS: il y a bien sûr, aussi, de nombreuses commandes équivalentes à celle du bash dans les modules os et os.path (et d'autres… sys… )
Un tour sur la doc Python donnera plus de renseignements

Voilà…

Clodion

Merci Clodion,
Mais mon but est d’exécuter ce qui normalement s’exécute via Bash(ubuntu) par:
export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

en un script python directement.
Je ne vois donc pas en quoi tu utilises la fonction "print", je pense que la solution est vers pour export:

Code:

---

os.environ['FREESURFER_HOME'] = "/usr/local/freesurfer"

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Mais quid de 'source'?

Merci par avance.
Frederic

Bonjour,

Sinon, souvent inconnu, le package subprocess, qui permet outre l'execution de la commande, d'attendre que la commande se termine, et même d'afficher la sortie standard dans l'écran, ou dans un log.

Ok, je m'en satisferai. merci beaucoup.
Frederic

Si les reponses apportees repondent à ta demande, un petit resolu, pour indiquer aux autres membres qu'une solution est disponible pour ce probleme.

Merci pour eux :ccool: