lecture fichier très lente en java

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09/09/2010, 01h17
infoinf

lecture fichier très lente en java

Salut

Voila j'ai développé une application qui me permet de supprimer les doublons d'un fichiers textes.

le problème c'est que quand je le lance avec des gros fichier (4 millions de lignes- 70Mo) ça prend énormément de temps plus de 48h.

j'utilise Bufferreader pour lire le fichier,je vérifie la validité de mes données et je réécrit mes resultats dans un autre fichier.

quelqu'un aurai une idée pour diminuer le temps de traitement?
09/09/2010, 09h09
CheryBen

Bonjour, 48h ça parait énorme. Il est difficile de dire comment diminuer le temps de traitement sans connaitre le code. Peux-tu le poster? (sans oublier la balise code)

La plupart du temps pour optimiser, il faut chercher du côté de l'algorithme utilisé. Il faut aussi éviter d'utiliser certaines classes synchronisées inutilement comme Vector ou HashTable.
09/09/2010, 09h29
Deaf

Il faut aussi éviter la concaténation de String et utiliser des StringBuilder.

C'est une erreur assez courante qui produit ce genre d'effets.

merci pour votre réponse,voila je met une partie du code qui fait le traitement

Code:

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BufferedReader reader = new BufferedReader(new FileReader(chemin));
            BufferedReader reader2 = new BufferedReader(new FileReader(chemin6));
 
            FileWriter fstream = new FileWriter("c:\\out-"+nomfichier+"-"+dat+".txt");
            BufferedWriter out = new BufferedWriter(fstream);
 
            String line = "";
            String line2 = "";
 
            while ((line2=reader.readLine()) != null) {
                String masque = "^[a-zA-Z]+[a-zA-Z0-9\\._-]*[a-zA-Z0-9]@[a-zA-Z]+"
 
                        + "[a-zA-Z0-9\\._-]*[a-zA-Z0-9]+\\.[a-zA-Z]{2,4}$";
 
Pattern pattern = Pattern.compile(masque);
 
Matcher controler = pattern.matcher(line2);
 
 
                if(controler.matches() ){
                    arrayOfStrings.add(line2);
 
                HashSet<String> h = new HashSet<String>(arrayOfStrings);
                arrayOfStrings.clear();
                arrayOfStrings.addAll(h);
                }
 
        }
            while ((line = reader2.readLine()) != null) {
 
                String masque = "^[a-zA-Z]+[a-zA-Z0-9\\._-]*[a-zA-Z0-9]@[a-zA-Z]+"
 
                        + "[a-zA-Z0-9\\._-]*[a-zA-Z0-9]+\\.[a-zA-Z]{2,4}$";
 
Pattern pattern = Pattern.compile(masque);
 
Matcher controler = pattern.matcher(line);
 
 
                if(controler.matches() && !arrayOfStrings.contains(line) ){
 
                    out.write(line + "\n");
 
 
                }

biensur je n'oublie pas de fermer les flux en fin de traitement

09/09/2010, 12h29
adiGuba
Salut,

Le code en lui-même n'est pas mauvais... mais comme il est exécuté un très grand nombre de fois (via les deux boucles) il faut faire attention à ce qu'on fait, et éviter les traitements et création d'objet inutile...

Quelques exemples :
Code:

1 2 3 String masque = "^[a-zA-Z]+[a-zA-Z0-9\\._-]*[a-zA-Z0-9]@[a-zA-Z]+" + "[a-zA-Z0-9\\._-]*[a-zA-Z0-9]+\\.[a-zA-Z]{2,4}$"; Pattern pattern = Pattern.compile(masque);
Tu défini le masque et crée le pattern au début de tes deux boucles, et à chaque itération. Or ce pattern ne change pas : il n'y a pas de raison de le recréer à chaque itération. Surtout que dans les regexp le plus coûteux vient de la création du Pattern justement.

:arrow: Initialises cela une seule et unique fois au début de ton code.
Code:

1 2 3 4 5 6 7 if(controler.matches() ){ arrayOfStrings.add(line2); HashSet<String> h = new HashSet<String>(arrayOfStrings); arrayOfStrings.clear(); arrayOfStrings.addAll(h); }
Ici si je comprend bien tu veux ajouter l'élément à la liste sans qu'il n'y ait de doublons. Donc à chaque fois tu crées un Set temporaire, tu vides la List et tu la re-remplie... :?

:arrow: Pourquoi ne pas utiliser directement un HashSet ? Ce serait plus simple et cela éviterai toutes ces manipulations. De plus l'appel de contains() sera lui aussi surement plus performant...

Code:

out.write(line + "\n");

Ici avec la concaténation tu crées une String temporaire. Ce n'est pas couteux en soit mais comme c'est fait un grand nombre de fois au bout du compte cela peut faire beaucoup.

:arrow: On peut éviter cela facilement :
Code:

1 2 out.write(line); out.write("\n");
Citation:

Envoyé par infoinf

biensur je n'oublie pas de fermer les flux en fin de traitement

Via des try/finally j'espère...

a++
11/09/2010, 18h33
infoinf

j'ai fais les modifications que vous m'avez suggéré et le résultat est hallucinant j'ai fais 400000 ligne en 12 minutes alors qu'il traitait les 400000 lignes en 5h.

je n'ai pas encore testé pour les 4 millions de ligne mais je pense que ça doit faire vers les 2h

merci encore une fois pour votre aide
11/09/2010, 21h38
tchize_

ben oui, en même temps faut avoir le reflexe de calculer un peut le temps de tes algorithme et t'aurais trouvé le problème tout de suite.
Le new HashSet prend un temps O(n log n) et le nouveaux ArrayList prend un temps O(n), n étant sa taille, donc proportionnelle à la taille du fichier. Donc on arrive avec la boucle en un O(n²log n). donc si pour 400.000 lignes t'en arrive à 20 minutes, pour 10 fois plus de lignes t'en arrive à plus de 100fois plus, soit donc plus de 30 heures ;)

Avec l'algorithme utilisant directement le hashset tu passe à un temps moyen N log N, ce qui amène l'algo à monter beaucoup plus lentement en consommation de temps. Pour une multiplication par 10 de la taille, on est dans l'ordre d'une multiplication similaire du temps de calcul (donc passage de 20 minute à 3h)