Possible ou pas possible ? ^^
Bonjour à tous ^^
Voila mon ou plutot mes problèmes questions ect.
J'ai un numéro d'accession et à partir de celui-ci je fais une recherche sur GenBank afin de récupérer au plus d'informations. Ce numéro d'accession est celui d'un gène donc je sélectionne la bdd "gene" et je demande pour l'organisme "Homo sapiens". Mon programme tourne sans de problème.
Mais voila il faudrait que je fasse un programme qui donne le choix entre différente bases de données afin d'obtenir le maximum d'infomations sur le gène. J'ai pensé à EMBL-EBI et j'ai trouvé le module Bio::DB::EMBL. Mais je ne trouve rien pour pouvoir l'exploiter comme je le souhaite. Donc je me demande si cela est possible de donner un gène de sélectionner bbd génome et de récupérer certaines informations sur chaque fiche? si oui comment?
Apres je suis tombée au hazard sur le site GeneCard qui donnes pas mal d'info prise à partir de divers autre sites. Mais je ne sais pas comment il est possible pour les récupérer.
Et enfin si vous avez d'autre idée de bbd pour le génome je suis preneuse ^^