Utiliser un thread en code Fortran

Bonjour,

J'ai un programme Python qui est divisé en:
- une IHM
- un thread de calcul

Le thread de calcul, bien qu'utilisant numpy, est lent à s'exécuter.

Le même calcul demande 50 à 80 fois moins de temps pour s'exécuter en Fortran :P

Il est pour moi très facile de faire le thread de calcul entièrement en Fortran sous forme d'un .exe, mais je ne vois pas :
1- comment l'appeler à partir du code Python
2- comment échanger quelques données entre le thread en Fortran et le programme Python
3- comment les synchroniser

J'ai survolé f2py, mais c'est plutôt adapté à l'insertion de code Fortran dans du code Python.
Dans mon cas, je préfèrerais carrément lancer le calcul sous forme d'un .exe en Fortran qui échangerait quelques données avec du code Python.

Si quelqu'un a déjà fait et/ou sait comment faire ... je suis preneur de toute information.

Bonne journée 8-)

Bonjour,

si tu choisis l'option d'utiliser un programme .exe fortran, tu peux te servir du module subprocess et notamment de la fonction subprocess.Popen.
Ca te permet d'exécuter un autre programme depuis Python et éventuellement récupérer ce qu'il écrit en sortie standard et/ou lui donner ce qu'il attend en entrée standard.

Par exemple, si tu as écrit un programme Fortran calcul.exe qui prend 2 entiers en argument et écrit un résultat en sortie standard.

Tu peux écrire ce genre de code dans un thread

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

import subprocess   val1 = .... val2 = .... #val1 et val2 sont les deux arguments pour le programme calcul.exe process = subprocess.Popen(['calcul.exe', str(val1), str(val2)], stdout=subprocess.PIPE) output = process.comunicate()[0] # traiter l'output de calcul.exe ....

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http://docs.python.org/library/subprocess.html

Pour f2py, je ne peux pas dire grand chose car je ne connais pas Fortran.

Sinon, une question, tu te sers de quelle bibliothèque pour ton IHM ?

Bonjour et merci,

Je regarde cela ce soir ou demain matin.

Pour l'IHM, j'utilise Tkinter.

Merci encore et bon dimanche.

bonjour,

si l'échange d'information dont tu parles s'effectue par l'intermédiaire de fichiers, via des arguments de lancement ou des entrées claviers subprocess.Popen est tout à fait indiqué.

si l'échange d'information doit être plus important, par exemple utiliser un tableau numpy défini dans ton code python dans ton programme fortran ou inversement, f2py est la meilleure option.

Salut,

Citation:

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J'ai survolé f2py, mais c'est plutôt adapté à l'insertion de code Fortran dans du code Python. Dans mon cas, je préfèrerais carrément lancer le calcul sous forme d'un .exe en Fortran qui échangerait quelques données avec du code Python.

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J'entends mais... un executable est une entité qui va demander un processus pour s'exécuter.
f2py travaille ailleurs: comment pousser le code Fortran dans une bibliothèque et poser dessus une API Python qui permette de la faire fonctionner?

=> Plutôt que d'avoir un .exe fortran "pur", vous avez un "main" python qui "parle" à une bibliothèque fortran à laquelle il accéde par un import du module qui va bien.
Dit autrement vous avez intégré le code Fortran dans l'environnement Python et vous pouvez même oublier qu'il s'agit de Fortran: vous ne verrez que l'API.
Cela permet notament de lancer la chose dans une threads (et pas seulement dans un process "à part") et d'avoir du python de bout en bout pour controler la bete.

- W
PS: Je raconte ca parce que s'il y a quelque chose qui est 'top' avec Python c'est justement de pouvoir réaliser ce type d'intégration de code.

Merci Beribibi, merci Kango, merci Wiztricks,


Bon, j'ai trouvé de la doc sur f2py (voir ici) et tenté de faire le bête exemple avec la suite de Fibonacci ...

Je n'arrive pas à lancer :
f2py -c fib1.f -m fib

Si je suis sur la shell Python ... je reçois un message "syntax error" avec fib1.f en surbrillance ...

Si je me mets sous Dos dans le répertoire C:\python26\lib\site-packages\f2pye ... je reçois le message "f2py n'est pas reconnu comme une commande" ...

Il semblerait que f2py soit mal installé, en effet quand je tape "f2py" sur la shell python, je reçois le message

Code:

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1 2 3 4

Traceback (most recent call last): File "<pyshell#0>", line 1, in <module> f2py NameError: name 'f2py' is not defined

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...

J'ai essayé plusieurs trucs, mais je suis perdu ..


Bonne journée

bonjour,

Code:

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f2py -c fib1.f -m fib

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est une commande pour le shell, pas pour python.

la doc est relative à un environnement Unix/Linux (voire Mac ?). Sur windows, il faut utiliser le script f2py.py qui se trouve dans:

C:\Python26\Scripts

donc tu peux te faire un script batch (.bat) dans lequel tu mets:

Code:

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C:\Python\python.exe C:\Python\Scritps\f2py.py -c fib1.f -m fib

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ou plus court:

Code:

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C:\Python\Scritps\f2py.py -c fib1.f -m fib

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Salut,

Vérifiez aussi que le répertoire C:\Python26\Scripts est dans le 'path' windows.
- W