JNI, petites difficultés

Bonjour,
J'ai en ce moment une application qui tourne en C++ et qui utilise une interface graphique en Java. En utilisant JNI, tout marche très bien, sauf lorsque j'utilise une classe extérieure aux classes "de bases de java". Par exemple, si j'utilise une méthode nécessitant "import trucMuche" mon application C++ ne veut même plus afficher quoi que ce soit codé en Java.
Est-ce normal, ou y-a-t-il une technique particulière pour résoudre ce problème ? J'ai bien essayé de déplacer le .jar contenant mes classes un peu partout mais sans succès.