regexp et compte d'éléments

Code:

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1 2 3

3'-TGAACGTACACTTTCCGGA-5' x|x||||x|| 5'-GCGAAATAAGCATGCAAGT-3'

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Code:

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1 2 3

3'-GGTACGTACATAATCCGTGTG-5' |||||||x|| 5'-AGGCCTACCACATGCAAGT-3'

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J'aimerais compter le nombre de pipes successifs qui commence au début.

Pour le premier exemple, ce serait donc 0 et pour le second, ce serait 7.

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

if (${$h_ref}{'Seq1'} =~ m/^\s+3/){   # on compte le nombre de pipes successifs en 3' my ($pipes) = ${$h_ref}{'Pipes'} =~ m/^\s+(\|*)/; my @array_pipes = split '', $pipes;   if (int(@array_pipes) >= $pipes_threshold){ ... } }

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Ce code fonctionne, avec ${$h_ref}{'Seq1'} contenant la première ligne (3'-GGTACGTACATAATCCGTGTG-5') et ${$h_ref}{'Pipes'} contenant la ligne des pipes.

Il doit y avoir moyen de faire plus simple, je pense à quelque chose de ce genre, mais il ne faut pas compter les pipes à l'extrémité droite après la croix :

Code:

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my $count = () = ${$h_ref}{'Pipes'} =~ m/[\s\|](\|)/g;

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Il faudrait donc une regexp qui recherche individuellement les pipes du début et qui s'arrête quand on trouve une croix.


Avez-vous une idée pour la regexp ou une autre solution qu'une regexp?

bon ce n'est pas très beau mais quelque chose du style fonctionnerait ?

Code:

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1 2 3 4 5

my $count = 0; if(${$h_ref}{'Pipes'} =~ /^\s*(\|+)/){ $count = length($1); }

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Je n'avais pas pensé à la fonction length(), c'est plus joli que de passer par un array comme je le fais. En attendant de trouver mieux, je vais utiliser

Code:

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1 2	my ($pipes) = ${$h_ref}{'Pipes'} =~ m/^\s+(\|*)/; my $count = length($pipes);

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Merci pour ton message.

Beniou, je ne vois pas en quoi ce n'est pas joli... tu veux dire que ce serait mieux en une seule instruction, comme ceci ?

Code:

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my $count = length([ ${$h_ref}{'Pipes'} =~ m/^\s+(\|*)/ ]->[0]);

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@jasmine : tu pourras ainsi analyser cette forme d'utilisation des références anonymes immédiatement déréférencées ;)

Citation:

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Envoyé par Philou67430

@jasmine : tu pourras ainsi analyser cette forme d'utilisation des références anonymes immédiatement déréférencées ;)

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:P Attends que je relise déjà 3 fois cette phrase avant de penser l'avoir comprise. ^^ Il me reste le WE pour plancher dessus.

Sans vouloir parler de plus 'joli' mais de plus 'efficace' comment savoir ce qui est préférable? Existe-t-il des règles simples? Le plus court n'étant pas toujours le plus efficace, comment peut-on savoir?

En l'occurrence, les deux écritures ont strictement la même complexité algorithmique.
La première utilise une variable nommée et deux instructions successives, tandis que la deuxième passe par une variable anonyme en une seule instruction.
En code machine, ça doit être quasiment identique.

Donc je te conseille d'utiliser celle que tu comprends le mieux, celle qui est le plus facilement maintenable dans ton contexte.

Citation:

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Envoyé par Philou67430

Donc je te conseille d'utiliser celle que tu comprends le mieux, celle qui est le plus facilement maintenable dans ton contexte.

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Ok, merci, je peux clore ce sujet.

Si tu choisis la première écriture, que cela ne te fasses pas renoncer à comprendre la 2e ;)

Citation:

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Envoyé par Philou67430

Si tu choisis la première écriture, que cela ne te fasses pas renoncer à comprendre la 2e ;)

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Si il y a une chose que je déteste c'est de resté dans l'ignorance. Je t'aurais demandé des explications si ça n'avait pas été clair.

Code:

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my $count = length([ ${$h_ref}{'Pipes'} =~ m/^\s+(\|*)/ ]->[0]);

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On récupère le contenu de $1 dans la première valeur d'un array anonyme et puis on regarde sa longueur. :ccool: Je n'aurais jamais pensé à faire ainsi, merci pour cette astuce.

C'est un peu le même principe utilisé parfois en programmation objet à l'aide d'objet "temporaire" (je sais pas comment ça s'appelle, si ça porte un nom):

Code:

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RGB my_blue = new COLOR("blue").get_rgb();

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Je ne suis pas sûr que ce code soit syntaxiquement correct en C++, mais c'est l'idée qu'il faut retenir. L'objet COLOR créé ne sert qu'à récupérer l'objet RGB pour la couleur bleue, cet objet étant immédiatement libéré (ramasse miette) après avoir été utilisé, car jamais référencé.

Citation:

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Envoyé par Philou67430

C'est un peu le même principe utilisé parfois en programmation objet à l'aide d'objet "temporaire" (je sais pas comment ça s'appelle, si ça porte un nom):

Code:

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RGB my_blue = new COLOR("blue").get_rgb();

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Je ne suis pas sûr que ce code soit syntaxiquement correct en C++, mais c'est l'idée qu'il faut retenir. L'objet COLOR créé ne sert qu'à récupérer l'objet RGB pour la couleur bleue, cet objet étant immédiatement libéré (ramasse miette) après avoir été utilisé, car jamais référencé.

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J'ai bien compris l'idée, merci.