R et ESS (Emacs Speaks Statistics)

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05/11/2009, 11h18
Haw27

R et ESS (Emacs Speaks Statistics)

Bonjour,
Je viens de migrer sur Ubuntu.
J'étais très fan de Tinn-R avec Windows mais là il n'est plus disponible sous linux.
J'ai essayé Rcmdr. Il semble vraiment sympas, mais il n'a pas les couleurs comme sous Tinn-R et c'est moins facile d'envoyer les lignes de commande (il faut se placer sur la ligne et cliquer sur soumettre... c'est plus long que sous Tinn-R !)
Bref, j'aimerais tester ESS (Emacs Speaks Statistics) car j'en ai lu beauoup de bien mais...
Comment on le lance ???
Je sais lancer R d'une part. Je sais lancer Emacs d'autre part, mais je n'arrive pas à lier ces 2 parts ! => comment faire le lien entre Emacs et R ?
Merci beaucoup,
Je suis aussi preneur de toutes les petites techniques pour utiliser R sous linux Ubuntu.
H-W

Bonjour,

Tu dois :

installer ESS (dans les paquets Ubuntu en principe),

configurer emacs pour qu'il charge ess + quelques personnalisations si tu le souhaites
Par exemple, un petit extrait de mon .emacs (dans /home/<user>/)

Code:

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;;################################################################################
;; Manipulating R files and invoking R:
;;################################################################################
 
(require 'ess-site)
(require 'ess-eldoc)
 
(ess-add-MM-keys)   ;; notamment pour des "squelettes" de fonctions
 
(autoload 'ess-rdired "ess-rdired"
  "View *R* objects in a dire-like buffer." t)
 
(setq-default ess-ask-for-ess-directory t)   ;; demande le dossier de travail à chaque démarrage de R
(setq-default ess-directory "/media/ifremer/Analyses/R/")  ;; répertoire de travail proposé par défaut
 
(add-hook 'ess-mode-hook
     '(lambda ()
       (auto-fill-mode t)
       ;;(flyspell-mode t)
       (setq-default fill-column 100)
       )
     )
 
;; Pour ajouter à la liste d'association les .Rhistory pour les traîter comme
;; des fichiers sources R
(setq auto-mode-alist
      (append
       '(("\\.[rR]history\\'" . R-mode))
       auto-mode-alist))
 
(define-key ess-mode-map [f6] 'comint-dynamic-complete-filename)
 
;; Montrer "au vol" les arguments de fonctions:
 
;; ess-r-args-noargsmsg is printed, if no argument information could
;; be found. You could set it to an empty string ("") for no message.
(setq ess-r-args-noargsmsg "No args found.")
 
;; ess-r-args-show-as determines how (where) the information is
;; displayed. Set it to "tooltip" for little tooltip windows or to
;; nil (the default) which will use the echo area at the bottom of
;; your Emacs frame.
;; (setq ess-r-args-show-as "tooltip")
 
;; ess-r-args-show-prefix is a string that is printed in front of the
;; arguments list. The default ist "ARGS: ".
(setq ess-r-args-show-prefix "ARGS: ")
 
(define-key ess-mode-map [(ctrl f12)] 'ess-r-args-show)
 
;; call ess-r-args-show automatically
(define-key ess-mode-map "(" '(lambda nil "" (interactive)
     (skeleton-pair-insert-maybe nil)
     (ess-r-args-show)
     ;; (")")
     ))
 
;; bind ess-r-args-insert to F3
(define-key ess-mode-map [f3] 'ess-r-args-insert)
 
 
(define-key inferior-ess-mode-map [(ctrl f12)] 'ess-r-args-show)

Il y a surtout des choses optionnels mais bien pratiques dans cet exemple... seules les premières lignes (require) sont requises.

lancer R depuis emacs : combinaison de touches M-x R RET (Alt-x R ENTER... mais faut tout de suite s'habituer aux notations emacs ;) )

Ensuite, depuis un fichier source, tu peux envoyer des lignes, expressions, régions (équivalent d'une sélection), etc. dans la console R (essaie de trouver la ESS refcard pour les raccourcis).

07/11/2009, 23h28
Haw27

Merci pour tout.
Emacs est vraiment hard comme interface, mais ça devrait aller avec ça !
09/11/2009, 16h20
ced

Citation:

Envoyé par Haw27

Je suis aussi preneur de toutes les petites techniques pour utiliser R sous linux Ubuntu.

Bonjour,

Jusqu'à il y a 6 mois environ, j'utilisais aussi Tinn-R sous Windows pour jouer mes scripts R.
Depuis, j'ai découvert le plugin StatEt sous Eclipse. Et là, tu as à disposition tout le côté convivial d'Eclipse (coloration syntaxique, auto-complétion, gestion par projets, explorateur d'objets R...) pour R.
C'est bourré de fonctionnalités très pratiques.

Je l'ai également installé sous Ubuntu. La configuration n'est pas toujours très évidente, mais on finit par s'en sortir ;).
Essaie-le.

ced
12/11/2009, 10h39
Haw27

Bonjour,
J'ai essayé d'utiliser Emacs ESS, RKward, Eclipse StatET et Rcmdr.
Rcmdr est le plus facile à utiliser.
Emacs ESS (j'ai encore rien compris !)
Eclips StatET : impossible de mettre StatET sur Eclipse 3.5, il faut donc télécharger Eclipse 3.3 ou 3.4 sauf que je n'ai pas réussi à trouver le 3.3 et que pour le 3.4, une fois télécharger, il ne fonctionnait pas ! Donc pas de StatET pour moi.
Enfin RKward : Je pensais qu'il n'était dispo que sur Kubuntu (oui, je suis encore très ignorant dans linux et je découvre que Ubuntu et Kubuntu on plein de point commun !). J' n'ai pas encore réussi à faire exécuter mes scripts mais il semble très interessant... voilà.
H-W
12/11/2009, 14h44
ced

Bonjour,

J'utilise la dernière version de StatEt sur Eclipse 3.5 (y compris sous Ubuntu 9.10) et tout fonctionne à merveille (à part un petit bug depuis la dernière mise à jour de la libraire rJava, en cours de correction)...
Pour Eclipse 3.5, l'URL d'installation de StatEt est la suivante :
http://download.walware.de/eclipse-3.5

ced
01/08/2010, 13h06
olivier-np30

Bonjour, heureux de trouver des utilisateurs de R sous ubuntu:

si qqn utilise geany et sais envoyer les lignes de codes sélectionnées sur R (comme tinn-R sur windows), merci pour votre aide ;)

A+