Production de documents avec R et Latex (Question complémentaire)

Bonjour,

J'arrive à faire des doc Latex à partir de R.
Attention avec mac pour les accents il faut utiliser

Code:

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\usepackage[applemac]{inputenc}

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à la place de

Code:

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\usepackage[latin1]{inputenc} %Avec PC

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Mais j'ai un petit problème voici un exemple de code qui marche tres bien

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

\documentclass[a4paper]{article} \usepackage[applemac]{inputenc} %Avec Mac %\usepackage[latin1]{inputenc} %Avec PC \begin{document} Essayons de calculer 2 + 2 : <<essai2plus2>>= 2 + 2 @ \end{document}

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Sauvé sous le nom de mini2.Rnw dans le répertoire ~/R

Quant j'exécute la commande

Code:

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Sweave("R/mini2.Rnw")

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J'ai le fichier mini2.tex dans le répertoire ~/
~/mini2.tex
Comment faire pour créer le fichier mini2.tex dans un autre répertoire ?

Cdt

Salut,

Code:

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\usepackage[utf8]{inputenc}

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fonctionne aussi très bien sur un mac

Pour répondre à ta question suivante, le fichier .tex se met dans le répertoire de travail (getwd() / setwd()) de R, d'ou ~/ par défaut

Oui en effet le fichier mini2.tex va dans le répertoire ~/
mais j'aimerai le mettre automatiquement dans un autre, il y a t il moyen de faire ça ?

Cdt

Il faut changer le répertoire de travail de R.

?setwd

En écrivant le code suivant

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13

setwd("~/R/figure")   \documentclass[a4paper]{article} \usepackage[latin1]{inputenc} \begin{document}   Essayons de calculer 2 + 2 :   <<essai2plus2>>= 2 + 2 @ \end{document}

---

j'ai un fichier .tex mais dans le répertoire ~/ et non dans le répertoire ~/R/figure

Si le code est executé depuis R, il faut changer le répertoire de travail DANS R et non DANS LE DOCUMENT.

J'ai effectivement un changement,
en écrivant

Code:

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1 2 3

> setwd("~/R/figure") > Sweave("R/mini2.Rnw")

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j'ai l'erreur suivante:

Citation:

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Writing to file mini2.tex
Processing code chunks ...
Erreur dans SweaveReadFile(file, syntax) :
un fichier Sweave de nom 'R/mini2.Rnw' est introuvable
De plus : Warning message:
In list.files(df, full.names = TRUE, pattern = paste(bf, syntax$extension, :
list.files : 'R' n'est pas un répertoire lisible

---

mais dans le répertoire

Code:

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~/R/figure

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j'ai un fichier mini2.tex mais il est vide

En fait, je pense que R cherche le fichier Sweave dans /R/figure

il faut que tu te mettes dans /R/

et dans ton fichier Sweave, tu met

Code:

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\SweaveOpts{prefix.string=figures/}

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Ce qui aura pour but de mettre les figures dans le dossier /figures/ de /R/, qu'il faut créer avant

Tout ça est dans la doc…

Bonjour,

Citation:

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Envoyé par Hydro999

Code:

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1 2 3

> setwd("~/R/figure") > Sweave("R/mini2.Rnw")

---

...
mais dans le répertoire

Code:

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~/R/figure

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j'ai un fichier mini2.tex mais il est vide

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Évidemment, tu te places dans le répertoire ~/R/figure et tu lance Sweave avec un chemin relatif faux (et Sweave ne trouve donc pas mini2.Rnw).
Il aurait fallu faire

Code:

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1 2 3

> setwd("~/R/figure") > Sweave("../mini2.Rnw") # relatif

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ou bien

Code:

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1 2 3

> setwd("~/R/figure") > Sweave("~/R/mini2.Rnw") # absolu

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Mais uniquement si tu souhaites que mini2.tex soit également dans le répertoire figure. Sinon, si tu souhaites juste que les images crées soient dans un sous répertoire par rapport à mini2.tex, alors fait comme TimoP te conseille avec les options.

C'est magique ça marche.

Merci pour ces trés précieuses indications

Cdt