Du shell à php

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29/04/2009, 17h45
Yuki_Hime

Du shell à php
Bonjour,

je fais mes pemiers pas en informatique et je me sens un peu décourager par la multitude de language qu'on me demande d'utiliser

je dois faire une interface web en php
et en background je fait des requêtes sur mon terminal

Code:

"fetchdom -b hogenom_v3 -d HBG000010 -fs " % " -t id,kw,la,nd,dr > fetch.txt"
- avec -b hogenom_v3 : ma base de donnée
- -d HBG000010 : retourne la famille de protéine que je veux étudier
- -fs est un filtre séparateur qui me permet de séparer tous les champs que j'ai choisi ( ID, ND, KW,...)
- par " % "
Imaginons qu'un utilisateur fasse une recherche comme celle là sur mon site, la requête me permet de séparer mes champs mais je voudrais enregistrer chacun de ses champs dans une variable que je pourrai afficher sur ma page php

Je ne sais pas du tout comment m'y prendre, j'ai lu de la doc, mais je n'y comprends pas grand chose;

Merci pour votre aide

Salut,
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 <?php $handle = @fopen("/tmp/inputfile.txt", "r"); if ($handle) { while (!feof($handle)) { $buffer = fgets($handle, 4096); echo $buffer; } fclose($handle); } ?>
En utilisant ceci tu devrait pouvoir gérer l'affectation de chaque ligne et exploiter chaque ligne par la suite.

Code:

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<?php
$requete_fetch = ('/home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b /home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/prodom_v2005 -a '.$requete.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,dr,inn,inntype,ht,spnb > idris_fetch.txt') ;
exec($requete_fetch);
 
$resultat_requete= "";
$handle = fopen("idris_fetch.txt", "r");
if ($handle) {
    while (!feof($handle)) {
         $resultat_requete= $resultat_requete.fgets($handle, 4096);
    }
    fclose($handle);
}
 
 
list($ID, $KW, $LA, $ND, $DR, $INN, $INNTYPE, $HT, $SPND, $CO) = explode(' % ', $resultat_requete) ;
print ("***********".$resultat_requete); ?>

merci ça m'a beaucoup aider j'ai du chercher à adapter un peu mais ça marche super:yaisse2:

30/04/2009, 16h55
Winnt

Si cela marche c'est parfait :D
30/04/2009, 17h11
Yuki_Hime

ben ya qd meme un petit point noir

Code:

Notice: Undefined offset: 9 in /home/idris/My_php/description_domain.php on line 53

qui apparait correspondant à la ligne

Code:

list($ID, $KW, $LA, $ND, $DR, $INN, $INNTYPE, $HT, $SPND, $CO) = explode(' % ', $resultat_requete) ;

je vois pas trop où est le blem.......???:oops:
02/05/2009, 15h57
Winnt

Salut,

Fait un "echo" de chaque ligne récupérée avant traitement.
donc avant

Code:

list($ID, $KW, $LA, $ND, $DR, $INN, $INNTYPE, $HT, $SPND, $CO) = explode(' % ', $resultat_requete) ;

Et vérifie que tu as bien toutes tes variables dans cette ligne. Je dirais que certaines lignes ne sont pas complètes.
04/05/2009, 11h08
Yuki_Hime

yeah t'es un génie thx !!
04/05/2009, 12h24
Winnt

Salut,

Citation:

Envoyé par Yuki_Hime

yeah t'es un génie thx !!

:mouarf3:

J'ai juste un peut tripatouiller php. ;)