Graphisme en java - JSP

Bonjour,
Je commence un projet où je dois coder des JSP pour dessiner automatiquement et dynamiquement à partir des données d'une base de données des réseaux de protéines (en biologie):
exple : http://ines.jilani.free.fr/img/reseau.jpg

Un truc comme ça, évidemment en + beau (genre remplacer les noms de protéines par des petites images par exemples), faire des liens dynamiques, si on clique sur une protéine, alors apparaissent tous ces liens fonctionnelles avec d'autres protéines..., si on survole avec la souris une protéine, qu'on puisse avoir d'autres données sur elle...

Je voulais donc savoir si vous aviez des idées de librairies, plugins que je pouvais utiliser, sachant que je dois coder des JSP (application web) et avec eclipse JEE.
Ou des codes à partir desquels je pourrais m'inspirer...

Toutes les idées sont les bienvenues (2D, 3D ?), j'ai programmé pas mal en JSP, mais je ne vois pas du tout comment aborder ce genre de problème graphique.
Merci à tous d'avance !!! :D

Tu as notamment la technologie Flash, Ajax aussi peut faire l'affaire mais le meilleur et préconisé par W3C pour le graphisme sur le web c'est le svg.
Comme librairie java pour faire du svg tu as Batik.

Merci pour ta réponse, le svg a l'air vraiment puissant.
D'après ce que j'ai lu le svg n'est pas reconnu par Internet Explorer, ça pose quand même quelques soucis.
Quelqu'un aurait-il d'autres idées ?

Le svg est reconnu par presque tout les navigateurs y compris Internet Exporer.Mais dans le cas de IE il te faut installer SVGViewer disponible chez adobe. Pour mozilla à partir de la version 1.5 c'est devenu natif.