Echange de clé SSH sous linux et Windows

Bonjour à tous.

Tout d'abord pardonnez moi si je me mélange un peu les pinceaux mais je suis loin d'être un expert en Linux (je tatouille un peu quand même ;) ).

Suite à la mise en place de OCS/GLPI je cherche à déployer l'agent OCS sur des machines UNIX grâce à leur outil : "OCS Deployment Tools" , mais il me demande de faire un échange de clé ssh.

Ca fait un moment que je cherche le fonctionnement de ce procédé mais comme je vous dis je commence à vraiment tout mélanger....
J'ai essayé de créé un couple de clé sous windows, idem sous linux, j'ai échangé les clés publiques (mais a vrai dire sous windows je ne sais pas trop où les mettre) et après plusieurs manipulations différentes je n'arrive toujours pas à déployer mon agent.

J'espère que quelqu'un pourra me renseigner, pas seulement me dire fais ci fais ça mais aussi m'expliquer un minimum le fonctionnement.

Merci d'avance.