Compilation sous eclipse avec cygwin

Bonjour,

Je travaille actuellement sur un projet ou j'utilise un robot lego nxt.
Je voudrait generer le fichier directement executable par le robot via eclipse.
Mon probleme est qu'en passant directement par la console de cygwin et en me mettant dans le dossier ou se trouve mon makefile mon .c et mon .oil (je code avec la norme osek) il me genere sans aucun probleme le fichier a transferer dans mon robot.
Puis avec eclipse j'arrive a le mettre dans la memoire du robot et a l'executer sur ce dernier.

J'aurais aimer savoir si quelqu'un avait une solution pour n'utiliser qu'eclipse.
Pour plus de renseignement vous pouvez aller voir le site suivant
http://lejos-osek.sourceforge.net/eclipse.htm

Merci beaucoup.