Lenteur de MATLAB sous Linux

Bonjour à tous,

j'utilise une application Matlab calculant les charges collectées aux électrodes dans un détecteur semi-conducteur. Cette application a été éprouvée par d'autre, donc je ne la remet pas en cause.
Par contre son temps d'exécution est relativement long : plus le temps passe et plus le temps de calcul est long ... j'ai posé la question au créateur de cette application qui me confirme que ce n'est pas normal ... mais lui utilise Matlab sous environnement Windows.
En faisant un "top", je remarque que Matlab est toujours en sleeping mode.
Voici une copie des infos de top :

PID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND
3704 user 18 0 988m 333m 43m S 100 17.7 15:51.69 MATLAB

Est-ce normal?

De plus, j'ai constaté que, même après redémarrage du PC et relance de Matlab, ce dernier met plusieurs minutes à s'initialiser alors que lorsuqe j'ai installé Matlab et commencer à découvrir cet environnement l'initialisation était quasi instantanée. Y-a-t-il une "purge" de mémoire à faire? si oui comment?

merci beaucoup

Est ce que tu as vérifié que ta configuration est supportée?

Citation:

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Envoyé par tug83

Est ce que tu as vérifié que ta configuration est supportée?

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j'utilise une scientific Linux 5.1 64bits qui repose sur une distribution Fedora. le kernel est une version 2.6.x, et je dispose de 2Go de RAM.
D'après ton lien je pense que c'est bon.

J'ai reçu la mise à jour Matlab 2008b mais ne l'ai pas encore installée. penses-tu que cela pourrais régler ce genre de problème?

Citation:

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Envoyé par Bombernator

J'ai reçu la mise à jour Matlab 2008b mais ne l'ai pas encore installée. penses-tu que cela pourrais régler ce genre de problème?

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En règle générale, c'est toujours mieux d'installer la dernière version de MATLAB qui corrige les bugs de la précédente.
Par exemple en 7b il y avait le problème de lenteur suivant
Why are UNIX, SYSTEM and ! slow on MATLAB 7.5 (R2007b) as compared to MATLAB 7.4 (R2007a) on a Linux 64-bit machine?
qui a été corrigé dans la 8a.

Sinon utilise le profiler de MATLAB pour voir où est exactement le goulot d'étranglement.

Je n'ai aps encore installé la dernière versio n sur ma station Linux, mais j'ai fait une installation de Matlab sur un portable Vista : le portable a calculé en 2h ce que la station a calculé en 3j ...

Un collègue m'a fait remarqué de regarder le Swap utilisé par Matlab sous Linux. Si je ne me trompe pas, d'après ce que j'ai indiqué plus haut, Matlab n'utilise que 333Mo de RAM et 988Mo de Swap. Sur le portable Vista (de configuration équivalente)seulement 300Mo environ sont utilisé en pagination.

S'il y a d'autre utilisateur Matlab sous Linux, qu'elle est la proportion RAM/Swap utilisée chez vous?

merci

beh sérieusement regarde le profiler de MATLAB ce qu'il t'indique parce que c'est anormal un tel écart.

Code:

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doc profile

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J'ai oublié de préciser que j'ai cette occupation de mémoire dès lancement de Matlab, sans faire tourner une seule macro.

je vais quand même essayer le profiler. Merci.

J'ai fermé toutes les fenêtres de l'éditeur, chose que je ne faisais pas avant.
J'ai quitté Matlab et fermé toutes les autres applications de ma session.
J'ai rebooté, me suis reloggué.

J'ai lancé matlab dans un autre répertoire que celui où se trouve mon application : initialisation rapide par rapport à précédemment quand je relançais matlab dans le répertoire de l'application et réouvrais tous les .m dans l'éditeur.
Je me suis placé dans le répertoire de l'application, ai ouvert le fichier principal et lancé mon application ...

et là ça carbure comme sur le portable Vista!!!
la répartition mémoire virtuelle et Rss est la même que précédemment.
Je comprends pas :arf:

Bon le problème semble résolu, mais par quel "miracle"?
y a t-il un espace mémoire (ou un fichier) que j'aurais purgé en fermant Matlab comme je l'ai fait? :roll:

si vou savais une explication, je suis preneur.

Tu veux dire que tu ne fermais jamais MATLAB pendant des jours?
Parce que le seul moyen de libérer toute la mémoire , c'est en effet de fermer MATLAB...au moins une fois le soir en quittant son boulot :P

sisi j'avais déjà fait des essai en redémarrant la station, mais ça ne résolvait pas le problème.
Par contre hier soir j'ai installé la version 2008b sans avoir redémarré et j'ai lancé mon application pour la nuit ... peut-être pour ça que je n'ai pas vu de différence .. jusqu'à maintenant : 3h30 de calcul au lieu de 4 semaines!!!! :yaisse2: