Problèmes pour utiliser Python.h

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Bonjour,

J'ai découvert swig et numpy récemment, mais j'ai quelques problèmes
pour utiliser ces outils.
Pour essayer de comprendre ce qui se passe je fais des tests.
En voilà un qui me pose un probleme.

Je peux compiler et exécuter les quelques lignes suivantes:

"""
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 #include <iostream> #include <Python.h> int main() { PyObject* list=PyList_New(5); std::cout<<"typeid list: "<<typeid(list).name()<<"\n"; std::cout<<"list check: "<<PyList_Check(list)<<"\n"; std::cout<<"list size: "<<PyList_Size(list)<<"\n"; std::cout<<"fin normale\n"; }
""""

Si maintenant je rajoute la ligne suivante:
"""

Code:

PyObject* pentier=PyInt_FromLong(long(10));

"""

la compilation passe, mais à l'exécution j'ai une
erreur de segmentation. Je ne vois pas du tout ce qui
se passe. Le débugeur d'Eclipse me dit ceci:

"""

Citation:

No symbol "new" in current context.
[Thread debugging using libthread_db enabled]
[New Thread -1212565280 (LWP 8711)]
Stopped due to shared library event
Current language: auto; currently c
[Switching to Thread -1212565280 (LWP 8711)]
Stopped due to shared library event
Stopped due to shared library event
Current language: auto; currently c++
Single stepping until exit from function PyInt_FromLong,
which has no line number information.
Couldn't get registers: Aucun processus de ce type.

"""

Je ne suis qu'un programmeur amateur et là ca ma dépasse un peu.
Si quelqu'un pouvait avoir la gentillesse de m'orienter ?
Merci infiniment !!!
Michel

27/09/2008, 19h16
Matthieu Brucher
Lance gdb sur le processus python :
Code:

1 2 gdb python run le_module.py

Bonjour,

Je voulais faire un petit exercice qui consistait à faire un typemap pour transformer un array en vector mais ca ne veut pas passer.
J'ai l'impression de n'avoir rien compris ....

Example.h:

Code:

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#include <iostream>
#include <vector>
 
void globale_print(std::vector<int> vint)
{
  std::cout<<"\n\tglobale_print vecteur: ";
  for (size_t i=0; i<vint.size(); i++)
  {
    std::cout<<vint[i]<<" - ";
  }
  std::cout<<"\n";
}

Example.i:

Code:

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%module example
 
%{
#include "example.h"
#include "arrayobject.h"
%}
 
/*
%typemap(python,in) std::vector<int>
{
  std::cout<<"\ttypeid $input: "<<typeid($input).name()<<"\n";
  std::cout<<"\tPyList_Check($input): "<<PyList_Check($input)<<"\n";
 
  int size=PyList_Size($input);
  std::cout<<"\tlist $input size: "<<size<<"\n";
  $1.resize(size);
  for (int i=0; i<size; i++)
  {
    $1[i]=PyInt_AsLong(PyList_GetItem($input,i));
    std::cout<<"\t$1[i]: "<<$1[i]<<"\n";
  }
};
*/
 
%typemap(python,in) std::vector<int>
{
  std::cout<<"\ttypeid $input: "<<typeid($input).name()<<"\n";
  std::cout<<"\t$input->ob_type: "<<$input->ob_type<<"\n";
 
  //std::cout<<"\tPyArray_Check($input): "<<PyArray_Check($input)<<"\n";
 
  PyArrayObject* aa=(PyArrayObject *) $input;
  $1.resize(aa->dimensions[0]);
  for (unsigned int i=0; i<aa->dimensions[0]; i++)
  {
    $1[i]= *(int *) (aa->data + i* aa->strides[0] );
  }
};
 
%include "example.h"

my_run.py:

Code:

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import example
from Numeric import *
 
#print "test avec list -> vector"
#list1=[1,2,3,4,5]
#print "\tlist1: ",list1
#example.globale_print(list1)
 
print "test avec array -> vector"
array=array(range(5))
print "\t",array
print "\t",type(array)
example.globale_print(array)

Tout marche bien quand j'utilise les listes python (parties commentées)
et aussi quand j'utilise les arrays python sauf pour la ligne:

Code:

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2
 
//std::cout<<"\tPyArray_Check($input): "<<PyArray_Check($input)<<"\n";

Si je tente de faire un PyArray_Check j'ai un "Erreur de Segmentation"

Et gdb m'envoie quelque chose que je ne sais pas utiliser ...:

Code:

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Program received signal SIGSEGV, Segmentation fault.
[Switching to Thread -1212324160 (LWP 23435)]
0xb7b1c53a in _wrap_globale_print () from /home/..../swig_TEST/_example.so
Current language:  auto; currently c

Matthieu je viens de découvrir que vous êtes un spécialiste !!
et j'ai commandé votre livre.
J'ai peut être mérité un commentaire ?!
Amicalement
Michel

29/09/2008, 17h03
Matthieu Brucher

Un spécialiste, c'est vite dit ;)

Je te conseille de commencer par passer à Numpy, l'avantage c'est qu'il y a des typemaps déjà proposés pour les tableaux C, c'est un début pour ce que tu cherches.

Par la suite, tapes "bt" avec gdb une fois que tu as le segfault pour voir exactement d'où il vient.

J'étais justement en train de tenter un bt, mais ca ne m'aide pas.
J'utilise python 2.4.1, Numeric 23.7 et swig 1.3.24

Code:

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(gdb) run my_run.py
Starting program: /home/francois/Travail/salome_3.2.2/Python-2.4.1/bin/python my_run.py
Reading symbols from shared object read from target memory...done.
Loaded system supplied DSO at 0xffffe000
[Thread debugging using libthread_db enabled]
[New Thread -1211976000 (LWP 12430)]
test avec array -> vector
        [0 1 2 3 4]
        <type 'array'>
        typeid obj0: P7_object
        obj0->ob_type: 0xb7b6aea0
 
Program received signal SIGSEGV, Segmentation fault.
[Switching to Thread -1211976000 (LWP 12430)]
0xb7b7153a in _wrap_globale_print (args=0xb7bb3f8c) at example_wrap.cxx:1375
1375            std::cout<<"\tPyArray_Check(obj0): "<<PyArray_Check(obj0)<<"\n";
(gdb) bt
#0  0xb7b7153a in _wrap_globale_print (args=0xb7bb3f8c) at example_wrap.cxx:1375
#1  0xb7ee4826 in PyCFunction_Call (func=0xb7ba98ec, arg=0xb7bb3f8c, kw=0x0) at Objects/methodobject.c:108
#2  0xb7f21863 in PyEval_EvalFrame (f=0x804c1ac) at Python/ceval.c:3547
#3  0xb7f22261 in PyEval_EvalCodeEx (co=0xb7c23ce0, globals=0xb7c05824, locals=0xb7c05824, args=0x0, argcount=0, kws=0x0, kwcount=0, defs=0x0,
    defcount=0, closure=0x0) at Python/ceval.c:2730
#4  0xb7f22382 in PyEval_EvalCode (co=0xb7c23ce0, globals=0xb7c05824, locals=0xb7c05824) at Python/ceval.c:484
#5  0xb7f45804 in PyRun_FileExFlags (fp=0x804a008, filename=0xbfdb653f "my_run.py", start=257, globals=0xb7c05824, locals=0xb7c05824,
    closeit=1, flags=0xbfdb5b14) at Python/pythonrun.c:1265
#6  0xb7f461d8 in PyRun_SimpleFileExFlags (fp=Variable "fp" is not available.
) at Python/pythonrun.c:860
#7  0xb7f476b0 in PyRun_AnyFileExFlags (fp=0x804a008, filename=0xbfdb653f "my_run.py", closeit=1, flags=0xbfdb5b14) at Python/pythonrun.c:664
#8  0xb7f4d2bd in Py_Main (argc=1, argv=0xbfdb5bd4) at Modules/main.c:484
#9  0x08048644 in main (argc=2, argv=0xbfdb5bd4) at ./Modules/ccpython.cc:10

Est ce qu'il y a quelque chose qui semble stupide dans ce petit test ?
A priori ca devrait marcher non ?

29/09/2008, 17h36
Matthieu Brucher

Maintenant regarde dans le fichier example_wrap.cxx à la ligne indiquée.
29/09/2008, 17h49
micheldup

La ligne qui plante est:

1375 std::cout<<"\tPyArray_Check(obj0): "<<PyArray_Check(obj0)<<"\n"

C'est précisément celle que je commente dans l'interface pour qu'elle n'apparaisse
pas dans le wrapper.

Bon ...
29/09/2008, 18h08
Matthieu Brucher

Vérifie dans le débuggeur la valeur de tes pointeurs. Il y a en a sans doute un qui est nul. Après, l'objectif est de savoir pourquoi et de corriger ça.