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| #!/usr/bin/perl
use Tk; # Utilisation de Tk
use Tk::Dialog; # Module pour la boîte de dialogue
use Bio::SeqIO; # Module de BioPerl pour analyse des séquences
use Tk::FileSelect; # Module de Tk pour la sélection d'un fichier
use File::Copy; # Module pour la fonction copy de fichier
use strict; # Vérifie la présence des variables
use warnings; # Gestion des erreurs
my $fen = MainWindow->new(); # Création de la fenêtre principale
$fen->geometry ("800x600+10+10"); # Taille de la fenêtre principale
$fen->title("Tk test"); # Définition du titre de la fenêtre principale
# Création de la barre de menu
my $barre_menu = $fen->Frame(-relief => 'groove' , -borderwidth => 2);
# Création de la barre du menu général
my $menu_app = $barre_menu->Menubutton
(
-text => 'Applications', # Définition du libellé du bouton
-font => '{Garamond} 10', # Définition de la police
-tearoff => 0 ,
-menuitems => [ # Ajout des options au menu
['command' => 'Change Bank',
-font => '{Garamond} 10',
-command => \&Select
],
['command' => 'Quitter',
-font => '{Garamond} 10',
-command => \&Quitter
]
]
);
# Affichage du menu général à gauche
$menu_app->pack(-side => 'left');
# Affichage de la barre de menu ancrée en haut et sur toute la largeur de la fenêtre
$barre_menu->pack(-side => 'top', -anchor => 'n', -fill => 'x');
MainLoop; # Ne pas l'oublier sinon pas d'affichage
#####################################
# Fonctions #
#####################################
sub Quitter
{
exit;
return;
}
# Fonction d'affichage de la fenêtre pour le changement de banque
sub Select
{
my $top1 = $fen->Toplevel;
$top1->geometry ("600x400+10+10"); # Taille de la fenêtre
$top1->title("Change Bank"); # Définition du titre de la fenêtre
$top1->Button(
-text => 'exit',
-command => [$fen => 'destroy']
)->pack(-side => 'bottom');
# Initialisation du fichier source
my $filenameOpen = 'Fichier à ouvrir :';
# Création de notre label d'affichage du fichier source
$top1->Label(
-relief => 'groove',
-textvariable => \$filenameOpen,
-font => '{Garamond} 10'
)->pack(
-fill => 'both',
-padx => '5',
-pady => '5'
);
# Ajout du bouton de choix du fichier source à la fenêtre
$top1->Button(
-text => 'Sélectionner un fichier', # Texte du bouton
-font => '{Garamond} 10', # Nom et taille de la police utilisée
-command => \&SelectFile # Action qui modifie notre variable
)->pack(
-pady => '5', # Marge externe du bouton
-padx => '5',
-ipady => '5', # Marge interne du bouton
-ipadx => '5'
);
# Initialisation du fichier à sauver
my $filenameSave = 'Enregistrer sous :';
# Création de notre label d'affichage du fichier à enregistrer
$top1->Label(
-relief => 'groove',
-textvariable => \$filenameSave,
-font => '{Garamond} 10'
)->pack(
-fill => 'both',
-padx => '5',
-pady => '5'
);
# Ajout du bouton 'Save as' à la fenêtre
$top1->Button(
-text => 'Saisir un nom de fichier', # Texte du bouton
-font => '{Garamond} 10', # Nom et taille de la police utilisée
-command => \&ChooseFile # Action qui modifie notre variable
)->pack(
-pady => '5', # Marge externe du bouton
-padx => '5',
-ipady => '5', # Marge interne du bouton
-ipadx => '5'
);
# Initialisation du mot-clé
my $valeur = '';
# Création de notre label d'affichage du mot sélectionné
$top1->Label(
-relief => 'groove',
-textvariable => \$valeur,
-font => '{Garamond} 10'
)->pack(
-fill => 'both',
-padx => '5',
-pady => '5'
);
# Ajout du bouton de sélection à la fenêtre
$top1->Button(
-text => 'Choix du mot à chercher', # Texte du bouton
-font => '{Garamond} 10', # Nom et taille de la police utilisée
-command => \&Chercher # Action qui modifie notre variable
)->pack(
-pady => '5', # Marge externe du bouton
-padx => '5',
-ipady => '5', # Marge interne du bouton
-ipadx => '5'
);
# Ajout du bouton de confirmation à la fenêtre
$top1->Button(
-text => 'Valider mon choix', # Texte du bouton
-font => '{Garamond} 10', # Nom et taille de la police utilisée
-command => \&Valider # Action qui modifie notre variable
)->pack(
-pady => '10', # Marge externe du bouton
-padx => '10',
-ipady => '5', # Marge interne du bouton
-ipadx => '5'
);
# Fonction de sélection d'un fichier
sub SelectFile
{
my $FileI = $top1->getOpenFile();
$fileOpen = 'Fichier sélectionné : ' . $fen->getOpenFile();
}
# Fonction permettant le choix du fichier d'enregistrement
sub ChooseFile
{
my $FileO = $top1->getSaveFile();
$filenameSave = 'Enregistrer sous : ' . $FileO;
}
# Fonction permettant la saisie du mot clé
sub Chercher
{
# Création de la boîte de dialogue
my $choice = $top1->DialogBox(
-title => 'Sélection du mot' ,
-buttons => [ 'Valider' , 'Annuler' ]
) ;
# Ajout du champ de saisie
$choice->add('Entry', -textvariable => \$valeur)->pack( -side => 'bottom');
# Récupération du tag
my $answer = $choice->Show();
my $tag = '';
if ($answer eq 'Valider')
{
$tag = $valeur;
}
else
{
$tag = 'Pas de valeur';
}
}
# Fonction de validation globale pour lancer l'opération
sub Valider
{
my $file = $FileI;
my $in = Bio::SeqIO->new(-file => $file, '-format' => 'Fasta');
my $match = $tag;
my $fileSave = $FileO;
my $garde = Bio::SeqIO->new(-file => $fileSave, '-format' => 'Fasta');
my $keep = Bio::SeqIO->new(-file => ">reste.fasta", '-format' => 'Fasta');
while ( my $seq = $in->next_seq()){
if($seq->desc =~ /$tag/){
$garde->write_seq($seq);
}
else{
$keep->write_seq($seq);
}
}
}
} |
