Probleme pour Automatisation d'un script

Bonjour à tous,
J'ai créé un script en Perl utilisant des threads qui réalisent pas mal d'opérations.
L'objectif étant d'effectuer les opérations automatiquement et de récupérer les résultats le lendemain.
J'ai testé le script et lorsque je le lance il s'exécute normalement mais le problème c'est qu'au bout d'un temps indéterminé il se met en pause tout seul, en tous cas il ne se termine pas et je suis contraint d'appuyer sur la toucher "Enter" pour le "relancer" et qu'il finisse son exécution.
Donc si je reviens le lendemain pensant que l'exécution est terminée alors qu'en fait il s'est arrêté au début c'est très contraignant.

Quelqu'un aurait-il une idée de solution au problème que je rencontre ??
(forcer l'exécution par exemple, je ne sais pas, ...)

Merci.

P.S : Je ne sais pas si cela peut avoir un rapport mais mes scripts sont exécutés en environnement Windows (et oui contraintes de boulot)