Commandes non reconnues

Bonjour

J'écris un script sh qui doit être appelé par une tierce application.
En fait, ce script invoque la commande BLAST bien connue des bioinformaticiens ;)

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

#!/bin/sh   if [ $# -ne 3 ] then exit 1 fi   USER=$1 shift BLAST_CMD=$1 shift PATH=$1   while [ `ps -fu $USER | grep -v grep | grep -c blastall` -ge 4 ] do sleep `perl -e 'int(rand(100)'` done cd $PATH $BLAST_CMD | at now + `at -l | wc -l` min

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Or, à l'exécution, j'ai les erreurs suivantes:

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8

BLAST.sh: line 14: ps: command not found BLAST.sh: line 14: grep: command not found BLAST.sh: line 14: grep: command not found BLAST.sh: line 14: [: -ge: unary operator expected BLAST.sh: line 19: wc: command not found BLAST.sh: line 19: at: command not found BLAST.sh: line 19: at: command not found

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Bien bizarre que des commandes simples comme ça ne soient pas reconnues :koi:
Si quelqu'un a une idée, il est le bienvenu.

@++

Code:

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sleep `perl -e 'int(rand(100)'`

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ça m'a tout l'air de manquer de parenthèse fermante :?

Salut ggnore
J'ai corrigé ce problème. Malgré tout, j'ai toujours les mêmes erreurs à l'exécution :(
Merci à toi de ta réponse toutefois.

@++

C'est quoi la ligne de commande pour invoquer ton script ?

Le troisième paramètre écrase la variable PATH. Donc si tu ne spécifies pas /bin et /usr/bin c'est probable que tu n'ais plus accès aux outils de base.

Tu as raison valefor, c'est ma faute, j'ai pas fait gaffe :scarymov::arf::bug:
Merci à toi, j'ai été négligent.

@++