Lecture de fichier texte et modification de valeurs

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Bonjour,

débutant sur MatLab, je sollicite votre aide

j'ai besoin d'écrire un programme pour lire un fichier texte et à partir de celui ci de créer une matrice de 180 lignes sur 288 colonnes. Cette matrice correspond à des données de longitudes (colonnes) suivant les latitudes (lignes).

je dispose à la base d'un fichier texte avec des données texte qui ne m'interessent pas et des milliers de valeurs!!!!
le fichier n'est pas à la base "rectangulaire" le nombre de colonnes est différent pour chaque donnée de latitude (elles vont de -89.5 à 89.5 tous les 1°)
voilà ci joint le début du fichier en question (il n'y a pas que des zéros comme valeurs, hormis pour les latitudes, elles sont toutes positives et s'echelonnent jusqu'à 999). voici le début du fichier texte qui fait 160ko

Code:

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Day: 1 Jan 1, 2004 EP/TOMS ARC 360 RES GEN:04.219 V8 ALECT: 10:58 AM 
 
Longitudes: 288 bins centered on 179.375 W to 179.375 E (1.25 degree steps) 
 
Latitudes : 180 bins centered on 89.5 S to 89.5 N (1.00 degree steps) 
 
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 
 
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 
 
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0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 lat = -89.5 
 
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0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 lat = -88.5 
 
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 
 
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0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 lat = -87.5 
 
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0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 lat = -86.5

je vous remercie par avance pour la lecture du message et un grand merci à ceux qui pourront m'aider

bonne journée

22/04/2008, 14h27
Caro-Line

Il y a plusieurs fonctions pour récupérer du texte dans MATLAB :
- textscan => voir l'aide, on peut lui donner plein d'arguments
- les fonctions bas niveau comme en c : fopen, fgetl, fclose qui permettent de lire les lignes 1 à 1

On ne peut t'aider plus ne sachant ce que tu veux conserver, ce que tu veux ignorer dans ton fichier.
22/04/2008, 19h54
Jerome Briot

Tu pourrais attacher ton fichier txt en le compressant en archive zip (la taille devrait énormément réduire...)

1 pièce(s) jointe(s)

je te file le fichier texte compressé

en fait les données texte jusqu'à steps ne m'interessent pas (3 premières lignes)

je souhaiterais créer une matrice de 180 lignes sur 288 colonnes
les 180 lignes correspondent à chaque lattitude
les 288 colonnes aux valeurs des longitudes pour chaque latitude

la premiere ligne correspond au premier bloc (que des valeurs 0 ici jusqu'à latitude -89.5, il y a 288 zéros)
dans la suite du fichier les valeurs ne dépassent pas 40 sauf qu'il y a des 999 pour indiquer une absence de valeur (voir fin du fichier) et parfois elles sont accollées donc difficile de les distinguer

en tout j'ai prés de 1000 fichier de la sorte a traiter alors je te remercie par avance si tu peux m'aider

voilà le tout premier de la liste, ils sont tous identiques

j'ai tapé le début du programme je sais pas si c'est juste mais il y a un souci avec les 999.
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 clear all close all; %demander le fichier à lire fichier = input('fichier ='); %fichier= '200401.txt' %ouverture du fichier, lecture du fichier et selection des lignes fid=fopen(fichier) A=textscan(fid, '%s','delimiter','','headerlines','2') fclose(fid); %affichage de la cellule resultat A{1}
merci pour l'aide

je commence à avancer!!!!

j'ai réussi à éliminer les lignes de texte qui me servaient à rien

j'obtiens un fichier qui fait 2160 lignes

il faut que j'arrive à remplacer dans chaque ligne la valeur 999 par "999+ un espace"
pour eviter d'avoir des lignes de 999 interrompues et ensuite il faudra que je mette dans une ligne mes 12 premieres lignes pour creer ma matrice. je bloque completement.

je vous file le debut du programme
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 clear all; close all; %demander le fichier à lire fichier = input('fichier ='); %fichier= '200401.txt' %ouverture du fichier, lecture du fichier et selection des lignes fid=fopen(fichier) A=textscan(fid,'%s','delimiter','','headerlines',3) fclose(fid); %affichage de la cellule resultat A{1} %affichage du nombre de lignes de la cellule nbligne=length(A{1}) %séparation des 999!!!!!
si jamais quelqu'un a une idée merci

à plus

24/04/2008, 10h59
niepoc

je bloque pour le remplacement de valeur!!!!

Bonjour tout le monde

j'ai réussi à trouver l'idée mais je bloque pour ecrire la suite du programme

pour remplacer mes 999 par '999+ un espace' il faut que je fasse trois étapes de remplacement

1 pour mes 999 accollés au chiffre 9 qui m'interesse je dois d'abord ecrire 9'espace'999999999.....en gros pour toutes mes suites de 9=4:3:75, le premier 9 doit etre remplacé par '9'espace''

2 meme raisonnement pour les valeurs qui m'intéressent pour X=19:10:99
la série qui commence par 19 (ou 29 ou 39...) je dois l'écrire '19'espace'999999....donc mes séries appelées A, de la forme A=X999999999...je dois l'ecrire X'espace'999999999

3 enfin derniere étape remplcé tous mes 999 par '999'espace'

bien sur 'espace' ici renvoie à un espace et non le mot

merci pour ceux qui ont une idée

bonne journée

C'est assez complexe en fait.
Une idée, pour les lignes où il n'y a pas "lat=", essayes la fonction sscanf :
Code:

1 2 3 4 ligneCourante=A{1}(nligne);%je ne suis pas sure du format de A donc à modifier si besoin %on enleve le 1er espace de la ligne : ligneCourante(1)=[]; vecteur=sscanf(ligneCourante,'%3d');%part du principe que chaque nombre prend 3 "places"
Je ne suis pas sure du tout de mon coup n'ayant pas MATLAB sous la main.

Après il faut aussi traiter spécifiquement les lignes où tu as "lat" à la fin.

Pourrais-tu donner un aperçu (2 ou 3 blocs par ex) de A{1} ?

merci pour ton aide

je te file quelques blocs avec mes histoires de 999

autrement j'ai posté le fichier zip avec le fichier en entier et mon debut de programme fonctionne et me donne mon A{1} en entier, message de hier

voilà quelques blocs

Code:

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 999999999 15 13 13 16 18 18 23999999999 16 16 17 18 20 22 18999999999 13 15
 
  14 16 15 15 14999999999 15 14 14 14 15 16 19999999999 15 16 19 22 21 21 23
 
 999999999 17 19 18 19 19 19999999999 17 15 13 17 15 16 17999999999 10 10 12
 
  12 10 12 12999999999 11 13 13 11 13 13 13 18 11 11 11 10  9 10 11 11 10  9
 
   8  9  9  8  7  5  5  6  7  7  8  8 13 11 11 12 13 17 16999999999 17 18 18
 
  20 20 19 21999999999 17 17 16 18 16 17 16999999999 13 12 11 12 13 13 13999
 
 999999 10 14 17 13 15 13 14 14 10 14 11 10 10  8  7  8  9 10  8 10 12 15 16
 
  17 19 15 11 14  8  9  7 11 14 14 14 15 14999999999 14 13 13 13 16 13999999
 
 999 17 19 19 20 20 21 19999999999 19 17 16 18 18 18 17999999999 18 15 15 17
 
  15 16 16999999999 13 14 15 17 19 21 20 19 20 22 14 13 16 17 17 17 16 14 15
 
  14 15 15 18 15 14 13 15  9 11 10 12 15 15 16 19 20 20999999999 18 18 20 18
 
  20 19 18999999999 20 20 19 20 20 20 19   lat =  -19.5 
 
 999999999 16 14 13 18 19 20 22999999999 14 16 17 19 19 21999999999999 15 16
 
  15 16 15 15999999999999 15 14 15 15 15 16999999999 13 16 18 20 20 20 20999
 
 999999 15 19 18 19 19 20 19999999999 16 13 15 15 14 15 15999999999 15 12 11
 
  11 12 15 14999999999 14 13 11 10 11 12 10 12 12  9  9 11 10  9  9  9  8  8
 
   7  7  8  7  6  5  5  6  6  7  5  7 11 10 11 13 14 17  9999999999 19 19 18
 
  19 19 20 20999999999 13 16 17 17 17 18 15999999999 11 10 12 14 12 12 13999
 
 999999 12 17 13 13 17 16 15 13 12 13 11 10  8  8  9  8  8  7  9 11 10 11 15
 
  15 15 12 13 11  6  6  6  9 13 13 12 12999999999 14 13 14 13 15 15 15999999
 
 999 22 20 21 22 21 21 20999999999 17 18 16 18 19 18 20999999999 17 15 15 13
 
  15 16 16999999999 15 16 15 17 19 21 21999999 16 14 13 15 15 14 17 13 13 12
 
  16 15 16 13 15 15 11 12 10 10 10 14 15 17 18 19 20 21999999999 17 18 19 20
 
  21 18 15999999999 19 16 19 22 22 15 15   lat =  -18.5 
 
 999999999 16 13 13 15 18 19999999999999 17 19 19 19 19 20999999999 14 14 13
 
  14 15 15 15999999999 16 14 15 14 14 13 17999999999 17 18 18 19 19 21 21999
 
 999999 16 17 16 18 20 17 18999999999 14 13 15 15 15 15 17999999999 14 12 13
 
  14 14 14 12999999999 15 10  9  9 11  9  8 11  5  8 10  8  8  9  9 10  7  7
 
   5  7  6  7  5  5  7  7  7  8  7  6  9 10 11 13 17 18 19999999999 17 18 18
 
  21 20 21 21999999999 16 16 17 17 17 16999999999 13 12 11 13 13 12 11999999
 
 999999 12 16 13 13 16 15 12 10 11 12 10  9  8  9  9  6  7 10 10 12 11 11 11
 
  13 13  9 17 11  8  6  5  9 13 14 11 10999999999 13 14 16 15 14 13 11999999
 
 999 18 17 19 21 21 20 20999999999 17 17 18 18 19 19 22999999999 17 15 14 15
 
  16 16 13999999999 14 14 14 17 18 21 19999999999 13 12 14 13 13 13  9 12 11
 
  13 12 14 12 10 11 11 10 11 11 11 15 16 18 18 17 19999999999999 17 19 18 19
 
  18 18999999999999 15 20 18 19 18 15 17   lat =  -17.5

merci encore pour ton aide et je te confirme que c'est compliqué

24/04/2008, 12h02
Caro-Line
Euh oui mais en fait ça ne me suffit pas.
J'ai besoin de connaitre exactement le format de A{1}...
Peux-tu me dire ce que retourne :
Code:

1 2 V=A{1}; whos V
ça donnera sa taille et sa class.
As-tu essayé sur une ligne avec sscanf voir ce que ça donne déjà ?
24/04/2008, 12h13
niepoc

quand je fais ta manip avec whos

j'obtiens ça comme réponse avec le copier coller que je t'ai envoyé

Citation:

Name Size Bytes Class Attributes

V 36x1 7386 cell

pour ton code il me signifie qu'il y a une erreur ce n'est pas une chaine en fait

Citation:

??? Error using ==> sscanf

First argument must be a string.

Error in ==> lecture at 23

vecteur=sscanf(ligneCourante,'%3d');%part du principe que chaque nombre prend 3 "places"

je me demande si le début de mon programme est bon si je suis bien parti

merci pour ton aide
24/04/2008, 12h18
Caro-Line

Citation:

Envoyé par niepoc

quand je fais ta manip avec whos

Non il me faudrait la "vraie" réponse.
Et pour l'erreur donc si A{1} est une cellule (dont il me faudrait le format), essayes éventuellement avec :

Code:

ligneCourante=A{1}{nligne};

Mais bon ce n'est pas facile à l'aveugle de savoir comment t'aider.
24/04/2008, 12h35
niepoc

je suis conscient que sans matlab devant les yeux c dur

je vois pas ce que c'esdt la "vraie réponse"

ce que je peux je peux te dire c que mon exemple de 3 blocs fait 36X1 donc 36 lignes

mon fichier une fois éliminé les lignes de texte fait 2160 lignes

sinon le code ligneCourante=A{1}{nligne}; j'ai le meme message d'erreur

Citation:

??? Error using ==> sscanf

First argument must be a string.

merci pour ton aide
24/04/2008, 13h51
Caro-Line

Et si tu enlèves le ; après

Code:

ligneCourante=A{1}{nligne}

ça te donne quoi dans la command window MATLAB ?
La "vraie" réponse c'est si tu le fais avec ta matrice A{1} récupérée de ton fichier.

pour ton code ligneCourante=A{1}{nligne}

ça me donne la derniere ligne de mon ma cellule

pour cet exemple

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
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10
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31
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39
40
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59
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61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
 999999999 15 13 13 16 18 18 23999999999 16 16 17 18 20 22 18999999999 13 15
 
  14 16 15 15 14999999999 15 14 14 14 15 16 19999999999 15 16 19 22 21 21 23
 
 999999999 17 19 18 19 19 19999999999 17 15 13 17 15 16 17999999999 10 10 12
 
  12 10 12 12999999999 11 13 13 11 13 13 13 18 11 11 11 10  9 10 11 11 10  9
 
   8  9  9  8  7  5  5  6  7  7  8  8 13 11 11 12 13 17 16999999999 17 18 18
 
  20 20 19 21999999999 17 17 16 18 16 17 16999999999 13 12 11 12 13 13 13999
 
 999999 10 14 17 13 15 13 14 14 10 14 11 10 10  8  7  8  9 10  8 10 12 15 16
 
  17 19 15 11 14  8  9  7 11 14 14 14 15 14999999999 14 13 13 13 16 13999999
 
 999 17 19 19 20 20 21 19999999999 19 17 16 18 18 18 17999999999 18 15 15 17
 
  15 16 16999999999 13 14 15 17 19 21 20 19 20 22 14 13 16 17 17 17 16 14 15
 
  14 15 15 18 15 14 13 15  9 11 10 12 15 15 16 19 20 20999999999 18 18 20 18
 
  20 19 18999999999 20 20 19 20 20 20 19   lat =  -19.5 
 
 999999999 16 14 13 18 19 20 22999999999 14 16 17 19 19 21999999999999 15 16
 
  15 16 15 15999999999999 15 14 15 15 15 16999999999 13 16 18 20 20 20 20999
 
 999999 15 19 18 19 19 20 19999999999 16 13 15 15 14 15 15999999999 15 12 11
 
  11 12 15 14999999999 14 13 11 10 11 12 10 12 12  9  9 11 10  9  9  9  8  8
 
   7  7  8  7  6  5  5  6  6  7  5  7 11 10 11 13 14 17  9999999999 19 19 18
 
  19 19 20 20999999999 13 16 17 17 17 18 15999999999 11 10 12 14 12 12 13999
 
 999999 12 17 13 13 17 16 15 13 12 13 11 10  8  8  9  8  8  7  9 11 10 11 15
 
  15 15 12 13 11  6  6  6  9 13 13 12 12999999999 14 13 14 13 15 15 15999999
 
 999 22 20 21 22 21 21 20999999999 17 18 16 18 19 18 20999999999 17 15 15 13
 
  15 16 16999999999 15 16 15 17 19 21 21999999 16 14 13 15 15 14 17 13 13 12
 
  16 15 16 13 15 15 11 12 10 10 10 14 15 17 18 19 20 21999999999 17 18 19 20
 
  21 18 15999999999 19 16 19 22 22 15 15   lat =  -18.5 
 
 999999999 16 13 13 15 18 19999999999999 17 19 19 19 19 20999999999 14 14 13
 
  14 15 15 15999999999 16 14 15 14 14 13 17999999999 17 18 18 19 19 21 21999
 
 999999 16 17 16 18 20 17 18999999999 14 13 15 15 15 15 17999999999 14 12 13
 
  14 14 14 12999999999 15 10  9  9 11  9  8 11  5  8 10  8  8  9  9 10  7  7
 
   5  7  6  7  5  5  7  7  7  8  7  6  9 10 11 13 17 18 19999999999 17 18 18
 
  21 20 21 21999999999 16 16 17 17 17 16999999999 13 12 11 13 13 12 11999999
 
 999999 12 16 13 13 16 15 12 10 11 12 10  9  8  9  9  6  7 10 10 12 11 11 11
 
  13 13  9 17 11  8  6  5  9 13 14 11 10999999999 13 14 16 15 14 13 11999999
 
 999 18 17 19 21 21 20 20999999999 17 17 18 18 19 19 22999999999 17 15 14 15
 
  16 16 13999999999 14 14 14 17 18 21 19999999999 13 12 14 13 13 13  9 12 11
 
  13 12 14 12 10 11 11 10 11 11 11 15 16 18 18 17 19999999999999 17 19 18 19
 
  18 18999999999999 15 20 18 19 18 15 17   lat =  -17.5

le résultat est

Citation:

ligneCourante =

18 18999999999999 15 20 18 19 18 15 17 lat = -17.5

sinon le who est le meme que tout a l'heure pour l'exemple,

Citation:

size 36, 36 lignes
nb bytes 7386
la classe cell
attributes rien

merci pour ton aide

24/04/2008, 14h24
Caro-Line
Peux-tu tester :
Code:

1 2 ligneCourante='999 17 19 19 20 20 21 19999999999 19 17 16 18 18 18 17999999999 18 15 15 17'; vecteur=sscanf(ligneCourante,'%3d')
Pour voir si c'est moi qui me plante complètement sur l'utilisation de sscanf ?
24/04/2008, 14h38
niepoc
Code:

1 2 3 ligneCourante='999 17 19 19 20 20 21 19999999999 19 17 16 18 18 18 17999999999 18 15 15 17'; vecteur=sscanf(ligneCourante,'%3d')
Citation:

vecteur =

999

17

19

19

20

20

21

199

999

999

99

19

17

16

18

18

18

179

999

999

99

18

15

15

17

merci je vois que tu as réussi à séparer en 3 entier les données accollées
ça va m'aider mais il faudrait que pour le cas du 19999999999 j'obtienne un 19 puis des series de 999
de meme si j'ai quatre 9 ou sept 9, il me faudrait un 9 puis une série de 999

c'est hyper compliqué à faire mais bon si j'y arrive ça sera trés trés utile
merci pour ton aide

Une idée :

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
X = textread('200401.txt','%s','delimiter','\n','headerlines',3);
 
M  = [];
 
for n=1:numel(X)
 
    temp = strread(X{n},'%3s');
 
    idx = strcmp(temp,'lat');
 
    if any(idx)
 
        M = [M ; str2num(char(temp{1:find(idx)-1}))];
 
    else 
 
        M = [M ; str2num(char(temp))];
    end
 
 
end
 
M = reshape(M,288,[]).';
 
M(M==999) = nan;
 
figure
imagesc(M)
axis image

24/04/2008, 15h08
Caro-Line
Citation:

Envoyé par niepoc

merci je vois que tu as réussi à séparer en 3 entier les données accollées
ça va m'aider mais il faudrait que pour le cas du 19999999999 j'obtienne un 19 puis des series de 999

Oui et bien c'est ce que ça fait avec ma solution, non ?
C'est grâce au formatage de ton fichier.
attention par contre :
- Chaque ligne commence par un espace supplémentaire qu'il faut enlever avant le sscanf. Exemple:
Code:

1 2 ligne=' ya un espace avant' ligne(1)=[] %et voilà l'espace est parti !
- Ca ne marchera pas bien avec les lignes où il y a "lat=" à la fin. A toi maintenant de t'inspirer de ce que tu fais pour les lignes "standard" pour ce cas particulier.

C'est à toi de jouer maintenant ;)
24/04/2008, 16h55
niepoc

merci dut pour ton debut de programme

ça marche en partie mais c'est déjà énorme ce que tu as écrit
en fait c au niveau de la séparation des caractères avec tous ces 999999999....

il y a trois cas qui se présentent et c'est là que réside la complexité du programme
sachant que mes valeurs ne peuvent pas dépasser dans ce cas 45

avec mes séries de 999999... si cette série 9 est accollée à un nombre compris entre 1et 9,le nombre de caractere de la série sera compris parmis les chiffres suivants: 4:3:75 (dans la command window matlab c parlant). dans ce cas il faut que le premier chiffre de la série soit détaché de tous les autres 9 (ce premier chiffre peut etre un 9)

deuxième cas, meme raisonnement que le premier, cette fois le nombre accollé est compris entre 10 et 45, le nombre de caractere de la série sera donc 5:3:75, et il faut que je le sépare de tous les autres 9 (sachant que ça peut etre un 19, un 29, 39...)

dernier cas et que tu as réussi à trouver c tous ces 9999... accolés et dont le nombre de caractere de la série sera 3:3:75...

en fait il faut que je fasse les deux premières étapes avant la troisieme pour faire ce programme complet....et là ça bug je vais essayer

merci tout de même pour ton aide précieuse

bonne soirée
25/04/2008, 17h32
niepoc

si quelqu'un a une idée je suis preneur merci