1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287
| package rdf.textures.glrlm;
import imagetiti.Image;
/**
* <p>Description : Cette classe calcule les caracteristiques de la "run length matrix" pour une image (vignette). Elles peuvent etre calculees
* dans plusieurs directions, mais dans ce dernier cas, une moyenne sera faite.<br>
* Liste des caracteristiques calculees :<br>
* - F0 => Short Run Emphasis, SRE.<br>
* - F1 => LONG Run Emphasis, LRE.<br>
* - F2 => Gray Level Non Uniformity, GLNU.<br>
* - F3 => Run Length Non Uniformity, RLNU.<br>
* - F4 => Run Percentage, RP.<br>
* - F5 => Low Gray Level Run Emphasis, LGLRE.<br>
* - F6 => High Gray Level Run Emphasis, HGLRE.<br>
* - F7 => Short Run Low Gray Level Emphasis, SRLGLE.<br>
* - F8 => Short Run High Gray Level Emphasis, SRHGLE.<br>
* - F9 => Long Run Low Gray Level Emphasis, LRLGLE.<br>
* - F10 => Long Run High Gray Level Emphasis, LRHGLE.<br>
* Inspire des articles suivants :<br>
* - K. Yogesan and T. Jørgensen and F. Albregtsen and K. J. Tveter and H. E. Danielsen, Entropy based texture analysis of chromatin structure in advanced
* prostate cancer. In 1996 in Cytometry, volume 24, pages 268-276.<br>
* - S. A. Karkanis and George D. Magoulas and Maria Grigoriadou and Dimitris A. Karras, Neural Network based textural labeling of images in multimedia
* applications. In 1999 in EUROMICRO, volume 2, pages 392-396.<br>
* - D.-H. Xu and A.S. Kurani and J.D. Furst and D.S. Raicu, Run-Length Encoding For Volumetric Texture. In 2004 in International Conference on Visualization,
* Imaging, and Image Processing (VIIP), pages 452-458.<br></p>
* <p>Packages necessaires : imagetiti.</p>
* <p>Copyright : Copyright (c) 2007.</p>
* <p>Laboratoire : LSIS.</p>
* <p>Equipe : Image et Modele, I&M (ex LXAO).</p>
* <p>Dernieres modifications :<br>
* 8 Avril 2008 => Creation.</p>
*
* @author Guillaume THIBAULT
* @version 1.0
*/
public class GlrlmFeatures extends GreyLevelRunLengthMatrix
{
/** Tableau qui va contenir toutes les caracteristiques.*/
private double[] Features = new double[11] ;
/** Variable qui va etre egale a la somme de tous les elements de la matrice.*/
private double Sum = 0.0 ;
/** Un simple constructeur vide.*/
public GlrlmFeatures()
{
super() ;
}
/** Un constructeur qui permet de modifier la taille de la run length matrix.
* @param nbNiveauxGris Le nombre de niveaux de gris a prendre en compte, ce sera la hauteur de la matrice.*/
public GlrlmFeatures(int nbNiveauxGris)
{
super(nbNiveauxGris) ;
}
/** Methode qui lance et gere les differentes etapes de calcul.*/
public void Calculer(Image image)
{
if ( image == null ) throw new Error("Paramètre image == null") ;
this.image = image ;
int x, y, i ;
int max ;
for (i=0 ; i < Features.length ; i++) Features[i] = 0.0 ;
for (i=0 ; i < dx.length ; i++)
{
if ( image.getWidth() > image.getHeight() ) largeur = image.getWidth() + 1 ;
else largeur = image.getHeight() + 1 ;
matrix = null ;
matriceajustee = null ;
matrix = new double[nbNiveauxGris][largeur] ;
for (y=0 ; y < nbNiveauxGris ; y++)
for (x=0 ; x < largeur ; x++)
matrix[y][x] = 0.0 ; // raz matrix
computeMatrix(dx[i], dy[i]) ;
// Moyenne
for (y=0 ; y < nbNiveauxGris ; y++)
for (x=0 ; x < largeur ; x++)
matrix[y][x] /= (double)dx.length ;
// On trouve la largeur de la matrice.
max = 0 ;
for (y=0 ; y < nbNiveauxGris ; y++)
for (x=0 ; x < largeur ; x++)
if ( matrix[y][x] > 0.0 && x > max ) max = x ;
// On trouve la largeur pour ajuster puis on moyenne
largeur = max + 1 ;
matriceajustee = new double[nbNiveauxGris][largeur] ;
for (y=0 ; y < nbNiveauxGris ; y++)
for (x=0 ; x < largeur ; x++)
matriceajustee[y][x] = matrix[y][x] ;
Sum = 0.0 ;
for (y=0 ; y < nbNiveauxGris ; y++)
for (x=0 ; x < largeur ; x++)
Sum += matriceajustee[y][x] ;
Features[0] += SRE() ;
Features[1] += LRE() ;
Features[2] += GLNU() ;
Features[3] += RLNU() ;
Features[4] += RP() ;
Features[5] += LGLRE() ;
Features[6] += HGLRE() ;
Features[7] += SRLGLE() ;
Features[8] += SRHGLE() ;
Features[9] += LRLGLE() ;
Features[10] += LRHGLE() ;
}
// On fait la moyenne.
for (i=0 ; i < Features.length ; i++) Features[i] /= (double)dx.length ;
}
/* ------------------------------------------------- Calcul des caractéristiques ------------------------------------------------- */
/** F0 - Short Run Emphasis, SRE. Courte isolongueur.
* @return SRE.*/
private double SRE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] / Math.pow(l+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/** F1 - Long Run Emphasis, LRE. Grande isolongueur.
* @return LRE.*/
private double LRE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] * Math.pow(l+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/** F2 - Gray Level Non Uniform, GLNU. Homogeneite spectrale.
* @return GLNU.*/
private double GLNU()
{
int n, l ;
double v, val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
{
v = 0.0 ;
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
v += matriceajustee[n][l] ;
val += v*v ;
}
return val / Sum ;
}
/** F3 - Run Length Non Uniform, RLNU. Uniformite.
* @return RLNU.*/
private double RLNU()
{
int n, l ;
double v, val = 0.0 ;
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
{
v = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
v += matriceajustee[n][l] ;
val += v*v ;
}
return val / Sum ;
}
/** F4 - Run Percentage, RP. Egalite des isolongueur (pourcentage primitives).
* @return RP.*/
private double RP()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += (double)(l+1) * matriceajustee[n][l] ;
return Sum / val ;
}
/** F5 - Low Gray Level Run Emphasis, LGLRE.
* @return LGLRE.*/
private double LGLRE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] / Math.pow(n+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/** F6 - High Gray Level Run Emphasis, HGLRE.
* @return LGLRE.*/
private double HGLRE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] * Math.pow(n+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/** F7 - Short Run Low Gray Level Emphasis, SRLGLE.
* @return SRLGLE.*/
private double SRLGLE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] / (Math.pow(n+1, 2.0) * Math.pow(l+1, 2.0)) ;
return val / Sum ;
}
/** F8 - Short Run High Gray Level Emphasis, SRHGLE.
* @return SRHGLE.*/
private double SRHGLE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] * Math.pow(n+1, 2.0) / Math.pow(l+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/** F9 - Long Run Low Gray Level Emphasis, LRLGLE.
* @return LRLGLE.*/
private double LRLGLE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] * Math.pow(l+1, 2.0) / Math.pow(n+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/** F10 - Long Run High Gray Level Emphasis, LRHGLE.
* @return LRHGLE.*/
private double LRHGLE()
{
int n, l ;
double val = 0.0 ;
for (n=0 ; n < nbNiveauxGris ; n++)
for (l=0 ; l < largeur ; l++)
val += matriceajustee[n][l] * Math.pow(n+1, 2.0) * Math.pow(l+1, 2.0) ;
return val / Sum ;
}
/* ---------------------------------------------------- Les getters ---------------------------------------------------- */
/** Methode qui retourne la liste des caracteristiques.
* @return Le tableau de double contenant les caracteristiques.*/
public double[] getFeatures()
{
return Features ;
}
/** Methode qui retourne une des caracteristiques.
* @return La valeur de type double de la caracteristiques.*/
public double getF(int i)
{
if ( i < 0 || i >= Features.length )
throw new Error("Numéro de Haralick's Features incorrect : " + i + ", attendu [0.." + (Features.length-1) + "].") ;
return Features[i] ;
}
} |