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Tout dépend, tout dépend. Pt'êt. C'est pas sûr, et faut voir.
On sait jamais, ça eut pû.
D'abord, quels types d'utilisateurs à ces trucs de distances minimales en polygones ? S'il s'agit de machins 3D comme je le suppute, forcément, les utilisateurs ont de ces choses ont en général des ordis gonflés.
S'il apparaît qu'il ne faut peut être pas exagérer, alors il faut approfondir l'algo, en recherchant ce qui peut être constant (voire même en le provoquant). Cela te permettra des gains mémoires (j'espère).
Et si c'est encore trop peu, alors il faudra utiliser une base de données. Mais là, il te faudra probablement des ID, qui ne sont rien moins que des constantes ; d'où l'intérêt du travail précédent.