Bonjour a tous est ce que quelqu'un connait un programme pour traiter les sorties blast en local.
Visualisation d'alignement graphique, extraction des HSP etc..
Version imprimable
Bonjour a tous est ce que quelqu'un connait un programme pour traiter les sorties blast en local.
Visualisation d'alignement graphique, extraction des HSP etc..
Salut,
Si tu cherches du tout cuit, ça sera un peu difficile.
Par contre il faut commencer par installer et "comprendre" des modules comme Bioperl (pour le parsing et l'extraction de données à partir de blast output, etc) et GD (pour tous ce qui est graphique)... Je veux dire que même si tout trouve un script tout prêt pour ce que tu cherches, je crois qu'il faut que tu t'équipes en certains modules indispensables avant de pouvoir utiliser ce genre de script "spécialisés". J'espère que ça aide !!
non en fait je fais un stage et je fais une interface graphique à blast.
mon interfce fonctionne, j'aurai donc voulut savoir s'il existe quelques modules a ajouter pour un traitement post blast