Matplotlip pcolormesh : refaire un diagrame x=alphabet, y=alphabet , z= proba lettre suivante

Bonjour,

J'essai de refaire ( en débutant), un "déchiffrement MCMC"
(vu sur cette vidéo "www.youtube.com/watch?v=z4tkHuWZbRA" de la (super) chaine de David Louapre).

J'ai préparé le texte du livre "Swan" (proposé par Mr Louapre sur son GitHub),
pour recueillir, dans une liste, les probabilités d'apparition d'une lettre (espace inclus i.e. 27 chars) après un autre.
Ainsi j'arrive à une liste de 729 sous-listes du type

Code:

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stat = [[' ', 4.21],[' a', 135.23],[' b', 56.12],....['zz', 4.00]]

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Puis, voyant ce joli "diagramme thermique" sur la vidéo..
Pièce jointe 598165
j'ai essayé de voir comment faire avec les explications trouvées sur https://matplotlib.org/stable/galler...sh_levels.html
Sauf que j'ai bricolé, cherché, rebricolé.. sans arriver à reproduire ce diagramme x=caractères(27), y=caractères(27), z=proba(729).

Pourriez-vous m'aider a comprendre ce qu'il faut apporter/dire à matplotlib pour avoir ce type de diagramme x,y avec échelle de couleur selon z?
Merci pour votre temps.
Jma

En fait, stocker stat, sous cette forme

Code:

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stat = [[' ', 4.21],[' a', 135.23],[' b', 56.12],....['zz', 4.00]]

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va être un peu difficile à exploiter. Il faut modifier cela pour avoir une représentation sous forme de matrice, que vous pourrez ensuite aisément afficher avec la fonction imshow ou matshow de matplotlib.

Exemple de mise sous forme de matrice, avec seulement 2 lettres, l'espace et le 'a'.

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16

characters = ' a' stat = [[' ', 4.21],[' a', 135.23],['a ', 56.12],['aa', 4.00]] print(stat)   stat = dict(stat) ## le dictionnaire est déjà un peu plus facile à exploiter print(stat)   n = len(characters) A = np.zeros((n,n))   for i in range(n): for j in range(n): A[i,j] = stat[characters[i]+characters[j]]   print(characters) print(A)

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Vous avez donc la matrice A, à afficher avec matplotlib, et si vous voulez légender les axes, et bien la légende se trouve tout simplement dans characters

Bonjour LG et merci pour votre aide :)

Je trouve jolie cette façon de faire avec le dico.
Donc j'ai (grâce à vous) l'axe Z avec ce tableau 2D de valeurs.

Pour le diagramme, j'ai vu sur le cite de matplotlib:

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

import matplotlib.pyplot as plt from matplotlib.colors import BoundaryNorm from matplotlib.ticker import MaxNLocator import numpy as np   np.random.seed(19680801) Z = np.random.rand(6, 10) x = np.arange(-0.5, 10, 1) # len = 11 y = np.arange(4.5, 11, 1) # len = 7   fig, ax = plt.subplots() ax.pcolormesh(x, y, Z)

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qui donne:
Pièce jointe 598291

j'essai de reproduire, pour mon mimer mon cas.

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from matplotlib.colors import BoundaryNorm from matplotlib.ticker import MaxNLocator   np.random.seed(19680801) x = np.arange(-0.5, 27.5, 1 ) y = np.arange(-0.5, 27.5, 1 ) Z = np.random.rand(27,27)   fig, ax = plt.subplots() ax.pcolormesh(x, y, Z)

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mais j'obtiens des cases rectangulaires et non carrées.
Pièce jointe 598292

Y a t il un moyen de faire que les cases soient en carrés?

Bonne journée :)

Qqch comme ax.set_aspect('equal') devrait correspondre à vos besoins

Super beaucoup LG! merci c'est exactement ce qu'il fallait..

Du coup j'arrive a un truc comme ça sur les 729 data:
Pièce jointe 598410

encore merci pour votre aide :)

Finalement, puisque ce fil a le mérite d'exister, je me permet une nouvelle question :oops:.

Sur le "bigramme" original de Mr Louapre: Il montre les x en haut, espace a gauche et le y a gauche espace en haut.
Perso j' suis arrivé avec x en bas espace a gauche et y a gauche avec espace en bas.

En somme il commence de positionner les valeurs de sa matrice dans coin haut gauche de la grille et moi dans le coin bas gauche.

Existe t'il un moyen, quand on se trouve dans mon cas, pour retrouver la position des axes de Mr Louapre?

Bonne journée.
Jma

L'auteur doit plutôt utiliser la méthode imshow que pcolor. Et cette méthode permet de gérer aussi là ou l'on veut placer l'origine (cf. la notice de la fonction imshow)

merci encore et pour tout lg_53