Problème d'installation de R version 4.0

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27/10/2020, 16h27
Eckmül

Problème d'installation de R version 4.0

Bonjour,

Je voulais savoir si quelqu'un serait apte à m'aider sur l'installation du R version 4.0 sur un Linux Ubuntu (#57~18.04.1-Ubuntu SMP Thu Oct 15 14:04:49 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux)
j'ai pu installer le fichier compressé mais quand je le compile je tombe sur un message d'erreur

J'ai installé le fichier compressé sur :
https://cloud.r-project.org/bin/linu....3.orig.tar.gz

J'ai extrait le fichier dans mes téléchargements et lancer le

Code:

./configure

là dedans qui m'a renvoyé le message suivant :
tout un tas de "checking" puis :

Code:

configure: error: PCRE2 library and headers are required, or use --with-pcre1 and PCRE >= 8.32 with UTF-8 support

et je ne peux donc pas lancer le "make" après

Merci d'avance de vos éventuelles réponses, cordialement !

Bonjour,

Si vous avez vraiment besoin de compiler R pour l'installer, pour répondre au message d'erreur, vous devez d'abord installer PCRE avec:

Code:

sudo apt install libpcre2-dev

Pour information, voici mon script pour télécharger, compiler, installer R sur un RaspberryPi:
J'en parle dans cet article de blog plus en détail : https://statnmap.com/fr/2019-08-30-c...y-pi-3-avec-r/
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 sudo apt-get install -y gfortran libreadline6-dev libx11-dev libxt-dev \ libpng-dev libjpeg-dev libcairo2-dev xvfb \ libbz2-dev libzstd-dev liblzma-dev \ libcurl4-openssl-dev libssl-dev apt libpcre2-dev \ wget openjdk-11-jdk texlive-latex-base cd /usr/local/src sudo wget https://cran.rstudio.com/src/base/R-4/R-4.0.2.tar.gz sudo su tar zxvf R-4.0.2.tar.gz cd R-4.0.2  ./configure --enable-R-shlib --prefix=/mnt/Iomega_HDD/R #--with-blas --with-lapack #optional make make install cd .. rm -rf R-4.0.2* exit cd
Ceci étant dit, si vous n'êtes pas sur ARM, je vous recommande d'utiliser les dépôts classiques pour Ubuntu. J'ai aussi fait un article de blog pour ça : https://rtask.thinkr.fr/fr/installat...-cartographie/

Merci pour les packages à installer, ça a l'air d'avoir changer des choses puisque la commande

Code:

./configure

a marché sans erreur cette-fois-ci mais un second soucis est arrivé avec la commande

Code:

make

qui m'affiche le message suivant :

Code:

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trying to compile and link a JNI program 
detected JNI cpp flags    : 
detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
Warning message:
In (function (n)  :
  input string '/home/eckmul/Téléchargements/R-4.0.3/library' cannot be translated to UTF-8, is it valid in 'ANSI_X3.4-1968'?
make[2]*: on entre dans le répertoire «*/tmp/Rjavareconf.x3Jxeh*»
gcc -I"/home/eckmul/Téléchargements/R-4.0.3/include" -DNDEBUG   -I/usr/local/include   -fpic  -g -O2  -c conftest.c -o conftest.o
conftest.c:1:10: fatal error: jni.h: Aucun fichier ou dossier de ce type
 #include <jni.h>
          ^~~~~~~
compilation terminated.
/home/eckmul/Téléchargements/R-4.0.3/etc/Makeconf:172: recipe for target 'conftest.o' failed
make[2]: *** [conftest.o] Error 1
make[2]*: on quitte le répertoire «*/tmp/Rjavareconf.x3Jxeh*»
Unable to compile a JNI program


JAVA_HOME        : /usr/lib/jvm/java-11-openjdk-amd64
Java library path: 
JNI cpp flags    : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /home/eckmul/Téléchargements/R-4.0.3
Done.